More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3216 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  100 
 
 		 287 aa  587  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  48.59 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  44.74 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  45.08 
 
 		 262 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  46.86 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  44.61 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  39.25 
 
 		 265 aa  225  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  42.91 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  42.15 
 
 		 267 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  41.13 
 
 		 279 aa  205  6e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  35.98 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  34.08 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  34.27 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1793  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.34 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324577  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  35.06 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.97 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  35.06 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  34.69 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 		 271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  34.69 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  34.43 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  34.43 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  34.43 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  32.96 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  34.07 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  32.1 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  32.58 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  32.58 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  32.58 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  32.58 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 		 266 aa  129  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 		 266 aa  129  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  32.58 
 
 		 271 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  32.96 
 
 		 271 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  32.96 
 
 		 271 aa  128  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  32.59 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  32.58 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  32.58 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  33.95 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  32.21 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1878  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.11 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  32.21 
 
 		 269 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  32.21 
 
 		 269 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  32.21 
 
 		 269 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  32.21 
 
 		 269 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  31.14 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  34.07 
 
 		 271 aa  122  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  33.21 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  32.59 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  30.19 
 
 		 265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  28.09 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  31.14 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  28.36 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  30.47 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  28.62 
 
 		 278 aa  103  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  27.72 
 
 		 273 aa  99.4  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  31.95 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  26.77 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  25.27 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1559  HAD superfamily hydrolase  27.17 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.847302  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  27.64 
 
 		 272 aa  90.5  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  26.77 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  26.88 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  25.99 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  25 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  25.68 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  26.18 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1558  HAD superfamily hydrolase  23.93 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  26.59 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  24.15 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  26.59 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  26.59 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.73 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  26.43 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  23.66 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  27 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  26.49 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  23.66 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  22.66 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  26.67 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  23.66 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  23.72 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  26.59 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.66 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  26.87 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  27.37 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  27.94 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  22.34 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  27.68 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  26.69 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  27.57 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  27.57 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  27.57 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  27.57 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  27.57 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  27.57 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2666  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.36 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.968723  normal  0.0125888 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  28.57 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>