177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2330 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
106 aa  215  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  67.92 
 
 
106 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.15 
 
 
99 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.11 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.37 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  43.24 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.88 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.68 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  40.66 
 
 
96 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.65 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.89 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.55 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.27 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  40.7 
 
 
102 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.55 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
100 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.04 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.35 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
100 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.52 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.55 
 
 
99 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.44 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.79 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  34.57 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.94 
 
 
96 aa  60.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  35.37 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  29.89 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.83 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.27 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.68 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  36.14 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.34 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.8 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0851  hypothetical protein  25 
 
 
98 aa  57  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  35.85 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.56 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  35.85 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  38.57 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.5 
 
 
104 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21560  hypothetical protein  41.67 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
96 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.24 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.98 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  28.89 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4464  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.35 
 
 
117 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.293182  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 
114 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.16 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.96 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  30.11 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.14 
 
 
104 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  29.87 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.39 
 
 
99 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326536  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.29 
 
 
110 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 
96 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.32 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  32.43 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.93 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.03 
 
 
99 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.93 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.93 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.93 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1803  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 
97 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.79 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  31.03 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.93 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  30.49 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 
95 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  28.87 
 
 
95 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 
108 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  28.87 
 
 
95 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
95 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 
99 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.78 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4337  quinol monooxygenase YgiN  32.94 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  28.77 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>