109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0667 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  70.48 
 
 
112 aa  160  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.76 
 
 
106 aa  150  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.67 
 
 
106 aa  150  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  67.92 
 
 
110 aa  148  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.62 
 
 
108 aa  143  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1870  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.49 
 
 
109 aa  142  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22480  hypothetical protein  59.05 
 
 
106 aa  139  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.75 
 
 
108 aa  137  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10140  hypothetical protein  59.05 
 
 
106 aa  134  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  55.77 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.55 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  55.77 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11140  hypothetical protein  56.6 
 
 
107 aa  124  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  43.4 
 
 
107 aa  104  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.74 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  34.09 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  32.56 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
114 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.13 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.37 
 
 
101 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.09 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.29 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  35.53 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.92 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  29.27 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  29.27 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.47 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  30.77 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.62 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  35.38 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  28.28 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.47 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  34.21 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
110 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.16 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3411  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.62 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 
97 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.6 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3918  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0584952  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.44 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.85 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.5 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  28.05 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  34.25 
 
 
98 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  29.27 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1130  hypothetical protein  30.12 
 
 
125 aa  44.3  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.71 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  27.71 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  27.71 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  27.71 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 
100 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  32.93 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  32.93 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  32.93 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  28.05 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6175  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.84 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  31.58 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.84 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.05 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.84 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.14 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  28.05 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 
99 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 
99 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
99 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.93 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3852  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.108914  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1187  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.73 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  30.49 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  37.31 
 
 
272 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  30.68 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  30.68 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  30.68 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.33 
 
 
97 aa  40.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1401  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>