More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0235 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  100 
 
 		 442 aa  879    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  55.35 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  58.03 
 
 		 476 aa  472  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  53.2 
 
 		 455 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  55.43 
 
 		 449 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  55.63 
 
 		 450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  57.11 
 
 		 443 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  51.72 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  52.4 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  51.03 
 
 		 449 aa  441  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  52.12 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  55.61 
 
 		 457 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  57.51 
 
 		 473 aa  413  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  53 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  49.66 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  56.74 
 
 		 569 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  49.35 
 
 		 480 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  45.58 
 
 		 473 aa  364  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  51.53 
 
 		 453 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  44.39 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  43.26 
 
 		 506 aa  317  3e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  40.33 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  42.13 
 
 		 461 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  35.76 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  35.99 
 
 		 453 aa  279  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  35.99 
 
 		 453 aa  279  8e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  35.76 
 
 		 453 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  35.76 
 
 		 453 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  35.76 
 
 		 453 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  35.76 
 
 		 453 aa  278  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  35.39 
 
 		 453 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  35.39 
 
 		 453 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  35.39 
 
 		 453 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  35.39 
 
 		 453 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  41.39 
 
 		 481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  38.37 
 
 		 449 aa  265  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  34.32 
 
 		 458 aa  247  3e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.42 
 
 		 454 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  35.09 
 
 		 449 aa  231  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  32.51 
 
 		 452 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35101  predicted protein  37.69 
 
 		 570 aa  199  6e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.57 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0962  dihydroorotase  33.64 
 
 		 474 aa  187  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.57 
 
 		 494 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34891  Allantoinase  39.64 
 
 		 579 aa  184  4.0000000000000006e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.93559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  30.47 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0624  amidohydrolase  35.8 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  31.21 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  31.95 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  29.61 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  29.61 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  29.61 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  30.73 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  29.37 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  29.37 
 
 		 428 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  29.37 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  29.37 
 
 		 428 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  32.51 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  29.37 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12610  dihydroorotase  34.62 
 
 		 459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0812321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  30 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  32.57 
 
 		 444 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  29.24 
 
 		 428 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  29.86 
 
 		 425 aa  166  9e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.8 
 
 		 425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  33.26 
 
 		 458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  34.49 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.07 
 
 		 424 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  32.72 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4635  Allantoinase  32.82 
 
 		 459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453471  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  32.1 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.8 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  36.46 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.26 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.39 
 
 		 434 aa  162  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  30.87 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  36.42 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4364  Allantoinase  31.79 
 
 		 459 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00228036 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  29.66 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  30.6 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.45 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  31.51 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.05 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.07 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  33.77 
 
 		 462 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0124  dihydroorotase  28.38 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00282243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  34.97 
 
 		 442 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17970  dihydroorotase  35.32 
 
 		 448 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  34.41 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.4 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  32.81 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.65 
 
 		 437 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  29.57 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  30 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.7 
 
 		 418 aa  154  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  33.77 
 
 		 435 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  33.25 
 
 		 432 aa  152  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3951  amidohydrolase  32.61 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.825589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.53 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  34.01 
 
 		 431 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>