More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5874 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5874  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  100 
 
 		 245 aa  500  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.88 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.88 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  30.49 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  30.49 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  32.94 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  30.4 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.47 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  31.95 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  29.1 
 
 		 249 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3696  transcriptional regulator, GntR family protein  29.58 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 258 aa  98.6  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 252 aa  98.6  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 256 aa  98.2  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  28.86 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5849  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2078  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1287  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 256 aa  95.1  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 240 aa  95.1  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4088  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199409  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  30.6 
 
 		 246 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3824  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2887  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0481832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  27.39 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 241 aa  93.2  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 261 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 261 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 256 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 266 aa  91.7  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  26.05 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  29.75 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  31.38 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 260 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.7 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  34.39 
 
 		 290 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  34.39 
 
 		 290 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1748  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  33.48 
 
 		 240 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20350  putative transcriptional regulator  33.91 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238526  normal  0.704224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  29.34 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4185  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188072  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0763  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0767  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3772  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  24.46 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  29.34 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3858  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.95264 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  24.38 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  28.84 
 
 		 232 aa  87  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  26.47 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5939  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0054  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 242 aa  86.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0056  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.96 
 
 		 232 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210738 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  28.93 
 
 		 239 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4125  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.1 
 
 		 245 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  28.93 
 
 		 239 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>