More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1990 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
253 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  94.47 
 
 
253 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  77.73 
 
 
247 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  77.73 
 
 
247 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  77.73 
 
 
247 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  67.6 
 
 
262 aa  316  3e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  67.59 
 
 
254 aa  315  5e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.8 
 
 
254 aa  306  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  60.08 
 
 
254 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  60.87 
 
 
254 aa  295  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  62.85 
 
 
254 aa  295  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  59.68 
 
 
254 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  61.11 
 
 
260 aa  285  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  58.89 
 
 
254 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.26 
 
 
254 aa  276  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.26 
 
 
254 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.87 
 
 
254 aa  274  9e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.95 
 
 
253 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  60.87 
 
 
254 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  59.29 
 
 
273 aa  268  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.37 
 
 
256 aa  261  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  59.2 
 
 
254 aa  261  8.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  52.96 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.4 
 
 
285 aa  241  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  51.41 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.04 
 
 
268 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.4 
 
 
249 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 
261 aa  209  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0811  short chain enoyl-CoA hydratase  45.78 
 
 
255 aa  202  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  46.34 
 
 
249 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.34 
 
 
249 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.31 
 
 
264 aa  202  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  46.34 
 
 
249 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  41.7 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.7 
 
 
273 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  44.53 
 
 
266 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  43.75 
 
 
269 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 
263 aa  191  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  42.05 
 
 
287 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  43.75 
 
 
269 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  43.75 
 
 
269 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.77 
 
 
269 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.38 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.69 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  41 
 
 
266 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
257 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 
271 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
270 aa  174  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
263 aa  171  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  41.76 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  41.76 
 
 
261 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 
261 aa  166  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  41.76 
 
 
261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  41.76 
 
 
261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  41.76 
 
 
261 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  41.76 
 
 
297 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  41.76 
 
 
297 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  41.76 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.76 
 
 
261 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 
260 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  41.76 
 
 
261 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  41.76 
 
 
261 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  41.76 
 
 
261 aa  163  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.39 
 
 
263 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  41.38 
 
 
297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  41.76 
 
 
261 aa  162  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2640  enoyl-CoA hydratase  42.58 
 
 
264 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
258 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  41 
 
 
261 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  40.23 
 
 
261 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 
259 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
267 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
259 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  39.02 
 
 
260 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
797 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  39.44 
 
 
260 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  38.85 
 
 
264 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  40.24 
 
 
250 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0542068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 
257 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
257 aa  155  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
257 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  39.84 
 
 
262 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  38.25 
 
 
259 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 
260 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.64 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2837  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
264 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  38.25 
 
 
259 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
260 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  40.84 
 
 
260 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  41.04 
 
 
259 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
266 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
260 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  36.03 
 
 
258 aa  150  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  33.72 
 
 
255 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 
258 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 
264 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 
260 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>