More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1850 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1850  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 461 aa  957    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.057592  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1738  glutamine synthetase catalytic region  64.35 
 
 		 463 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  32.51 
 
 		 435 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  31.54 
 
 		 435 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  31.77 
 
 		 435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  31.86 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  33.6 
 
 		 461 aa  206  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  30.5 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  29.56 
 
 		 444 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  30.63 
 
 		 453 aa  199  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  29.93 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  31.75 
 
 		 438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  30.13 
 
 		 442 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  29.84 
 
 		 444 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  31.46 
 
 		 463 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  32.19 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  28.57 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  29.42 
 
 		 456 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  30.41 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  29.37 
 
 		 459 aa  190  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  30.97 
 
 		 435 aa  189  9e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  30.14 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  33.86 
 
 		 432 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  32.07 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  27.49 
 
 		 448 aa  183  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  30.82 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  30.8 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  30.56 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  30.18 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  31.14 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  31.59 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  29.03 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  30.65 
 
 		 443 aa  180  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  31.73 
 
 		 444 aa  180  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  29.04 
 
 		 441 aa  180  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  28.95 
 
 		 444 aa  179  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  28.29 
 
 		 444 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  31.68 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  28.6 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  32.81 
 
 		 439 aa  177  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  30.32 
 
 		 444 aa  176  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  31.51 
 
 		 442 aa  176  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  29.3 
 
 		 444 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  28.98 
 
 		 449 aa  176  9e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  29.36 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  28.98 
 
 		 456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  33.42 
 
 		 445 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  30.58 
 
 		 432 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  29.96 
 
 		 444 aa  172  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  32.37 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  28.48 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  30.44 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  29.54 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  30.82 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  30.89 
 
 		 451 aa  171  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  28.6 
 
 		 448 aa  169  7e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  30.26 
 
 		 442 aa  169  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  29.59 
 
 		 444 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  27.25 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  30.24 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  28.26 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  27.75 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  31.93 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  28.99 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  31.92 
 
 		 443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  28.48 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  29.32 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  31.2 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  29.41 
 
 		 442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  30.59 
 
 		 446 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  28.78 
 
 		 446 aa  166  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  27.19 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  31.22 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  31.43 
 
 		 444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  32.37 
 
 		 449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  31.43 
 
 		 444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  27.55 
 
 		 440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  30.85 
 
 		 446 aa  163  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  30.53 
 
 		 446 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  31.17 
 
 		 444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  31.17 
 
 		 444 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  31.17 
 
 		 444 aa  163  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  31.17 
 
 		 444 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  31.17 
 
 		 444 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  27.73 
 
 		 439 aa  163  6e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  30.4 
 
 		 445 aa  163  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  31.17 
 
 		 444 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  32.06 
 
 		 457 aa  162  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  32.06 
 
 		 457 aa  162  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  30.04 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  29.98 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  31.41 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  29.63 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  28.32 
 
 		 451 aa  162  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  28.17 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  30.92 
 
 		 453 aa  162  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2016  glutamine synthetase, type I  30.74 
 
 		 447 aa  162  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  hitchhiker  0.0000000000000396297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  28.17 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  29.41 
 
 		 447 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>