More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1738 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1738  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 463 aa  967    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1850  glutamate--ammonia ligase  64.35 
 
 		 461 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.057592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  32.39 
 
 		 464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  33.85 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  32.68 
 
 		 444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  34.75 
 
 		 435 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  33.12 
 
 		 459 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  34.45 
 
 		 438 aa  217  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  33.94 
 
 		 461 aa  216  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  31.89 
 
 		 444 aa  216  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  32.41 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  32.89 
 
 		 435 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  33.18 
 
 		 435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  32.76 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  33.11 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  33.56 
 
 		 432 aa  210  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  32.13 
 
 		 446 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  31.32 
 
 		 444 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  32.24 
 
 		 446 aa  206  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  31.66 
 
 		 442 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  32.29 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  30.67 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  32.88 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  32.82 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  32.43 
 
 		 432 aa  203  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  31.99 
 
 		 444 aa  202  9e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  32.28 
 
 		 432 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  32.03 
 
 		 451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  33.11 
 
 		 432 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  30.54 
 
 		 435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  30.02 
 
 		 448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  29.71 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  31.45 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  32.03 
 
 		 452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  31.24 
 
 		 444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  30.68 
 
 		 444 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  30.42 
 
 		 445 aa  197  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 448 aa  196  7e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  29.96 
 
 		 441 aa  196  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  32.23 
 
 		 445 aa  196  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  30.15 
 
 		 446 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  31.07 
 
 		 442 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  30.15 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  30.99 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  30.6 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  32.75 
 
 		 451 aa  193  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  30.35 
 
 		 443 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  30.77 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  30.77 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  30.77 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  30.77 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  32.82 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  30.77 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  30.82 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  29.32 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  32.82 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  30.77 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  32.82 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  30.49 
 
 		 434 aa  190  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  30.55 
 
 		 444 aa  190  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  30.04 
 
 		 447 aa  189  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  28.88 
 
 		 442 aa  189  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  31.45 
 
 		 453 aa  189  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  31.99 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  31.01 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  30.33 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  31.07 
 
 		 439 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  29.6 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  32.36 
 
 		 443 aa  187  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  29.69 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  30.4 
 
 		 449 aa  186  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  30 
 
 		 443 aa  186  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 444 aa  186  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 444 aa  186  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  32.47 
 
 		 455 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  29.81 
 
 		 456 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  28.82 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  31.15 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  29.81 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  30.65 
 
 		 449 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  30.18 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  29.75 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  29.65 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  29.07 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  29.28 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  28.89 
 
 		 437 aa  180  4e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  30.29 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  33.18 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  32.35 
 
 		 447 aa  178  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  29.65 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  32.27 
 
 		 439 aa  179  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7497  Glutamate--ammonia ligase  32.44 
 
 		 445 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  29.91 
 
 		 452 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  29.5 
 
 		 445 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  30.85 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  31.37 
 
 		 461 aa  177  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  30.82 
 
 		 453 aa  177  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  29.09 
 
 		 450 aa  176  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>