52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1489 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3472  hypothetical protein  59.1 
 
 		 710 aa  885    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00128156 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1717  phosphoesterase, RecJ-like  56.91 
 
 		 612 aa  699    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.35157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1805  phosphoesterase, RecJ-like protein  59.38 
 
 		 707 aa  884    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1073  phosphoesterase RecJ domain protein  59.17 
 
 		 612 aa  725    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0779999  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 		 722 aa  1477    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1586  phosphoesterase domain-containing protein  57.43 
 
 		 611 aa  691    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.75872  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0735  hypothetical protein  53.3 
 
 		 612 aa  676    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1551  phosphoesterase domain-containing protein  55.13 
 
 		 611 aa  666    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428573  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0217  phosphoesterase domain-containing protein  40.43 
 
 		 758 aa  566  1e-160  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0559  phosphoesterase domain-containing protein  39.18 
 
 		 761 aa  559  1e-158  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1359  phosphoesterase domain-containing protein  39.31 
 
 		 761 aa  555  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.710726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0279  phosphoesterase domain-containing protein  39.18 
 
 		 761 aa  553  1e-156  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2119  phosphoesterase RecJ domain protein  46.99 
 
 		 634 aa  540  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0624  phosphoesterase domain-containing protein  39.45 
 
 		 761 aa  537  1e-151  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0619  phosphoesterase RecJ domain protein  46.76 
 
 		 637 aa  532  1e-150  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.205669  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0717  phosphoesterase RecJ domain protein  44.89 
 
 		 641 aa  528  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2404  phosphoesterase RecJ domain protein  45.37 
 
 		 648 aa  527  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1907  phosphoesterase RecJ domain protein  44.97 
 
 		 636 aa  509  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2720  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.17 
 
 		 735 aa  256  7e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0876  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.08 
 
 		 732 aa  236  9e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.836846  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1616  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.92 
 
 		 725 aa  236  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837282 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2195  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.67 
 
 		 731 aa  217  7e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2931  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.65 
 
 		 730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.522801  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0087  chaperone protein DnaJ  36.84 
 
 		 373 aa  54.7  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.60044  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0078  chaperone protein DnaJ  40.26 
 
 		 369 aa  51.2  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0264458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0078  chaperone protein DnaJ  40.26 
 
 		 369 aa  50.8  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000211475  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  35.42 
 
 		 384 aa  50.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  27.81 
 
 		 736 aa  50.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  36.47 
 
 		 375 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0260  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.13 
 
 		 708 aa  48.1  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0777668  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07680  chaperone protein DnaJ  36.9 
 
 		 373 aa  47.8  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.447562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3191  chaperone protein DnaJ  35.29 
 
 		 375 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2928  chaperone protein DnaJ  35.29 
 
 		 375 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  26.06 
 
 		 469 aa  47  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1521  chaperone protein DnaJ  33.77 
 
 		 388 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173202  normal  0.704316 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0797  heat shock protein DnaJ domain protein  36.36 
 
 		 369 aa  46.6  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.95295 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.22 
 
 		 732 aa  46.6  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0265  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.57 
 
 		 164 aa  46.2  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  28.04 
 
 		 427 aa  46.6  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0903  hypothetical protein  31.82 
 
 		 369 aa  45.4  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25 
 
 		 1102 aa  45.8  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0138959 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.95 
 
 		 865 aa  45.8  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3421  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.56 
 
 		 788 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.507063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4973  chaperone protein DnaJ  30.93 
 
 		 386 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0482542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  34.48 
 
 		 377 aa  45.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  34.57 
 
 		 378 aa  45.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.45 
 
 		 566 aa  44.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.05 
 
 		 503 aa  44.3  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  31.73 
 
 		 133 aa  44.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  31.73 
 
 		 133 aa  44.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000417558  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0379  chaperone protein DnaJ  34.94 
 
 		 376 aa  44.3  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  32.97 
 
 		 132 aa  43.9  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>