More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3468 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3468  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  535  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2553  ABC transporter related  47.18 
 
 		 254 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1426  ABC transporter related protein  49.56 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  45.7 
 
 		 262 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0892  ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0662461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2845  ABC transporter related  46.93 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1374  ABC transporter-related protein  43.53 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  47.56 
 
 		 255 aa  208  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_29  iron ion ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 248 aa  191  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1170  ABC transporter related  47.72 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.842608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  36.44 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  39.52 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  41.38 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  37.3 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  37.97 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  36.29 
 
 		 262 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  36.68 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  37.45 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  36.86 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  37.45 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  38.16 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1655  ABC transporter related  44.39 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339871  normal  0.278117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 		 256 aa  155  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.17 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  38.57 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.23 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  37.78 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  32.02 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  33.6 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  34.15 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  34.27 
 
 		 285 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  36.84 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  34.06 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  39.91 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  34.13 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  38.59 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  34.8 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  36.48 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  35.86 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  35.6 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  36.02 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  37.29 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  40.25 
 
 		 264 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1532  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  34.15 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  32.77 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  35.86 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  37.5 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  34.57 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.87 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  33.06 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  35.02 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  38.24 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  32.03 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  32.05 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  34.88 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  37.4 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.4 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  31.33 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  39.15 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  29.96 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.76 
 
 		 253 aa  139  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  36.86 
 
 		 261 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  33.19 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  37.87 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1183  ABC transporter, ATP-binding protein  34.72 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  32.44 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  36.29 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  36.95 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  34.96 
 
 		 263 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  32.5 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  33.33 
 
 		 280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  36.72 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.14 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  33.2 
 
 		 296 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  33.89 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  35.74 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  36.84 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1513  ABC transporter related  38.24 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  36.9 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  31.3 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  33.61 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  37.44 
 
 		 276 aa  132  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  36.43 
 
 		 490 aa  132  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  36.32 
 
 		 248 aa  131  9e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  30.13 
 
 		 418 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  36.29 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  37.05 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  33.74 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  33.73 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.7 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  36.1 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  33.93 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.7 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  32.4 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>