More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3202 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  100 
 
 		 197 aa  387  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  56.54 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  57.87 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  52.13 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  57.54 
 
 		 201 aa  184  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5252  cytochrome B561  54.55 
 
 		 156 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  40.98 
 
 		 441 aa  128  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  43.09 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  43.24 
 
 		 178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  43.09 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  41.05 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  41.01 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  41.01 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  41.01 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  42.16 
 
 		 188 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  40.45 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  42.62 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  41.51 
 
 		 416 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  43.33 
 
 		 189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  40.45 
 
 		 186 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  41.53 
 
 		 185 aa  118  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  38.95 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  40.45 
 
 		 186 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  38.95 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  44.26 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  37.89 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  42.62 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  37.89 
 
 		 199 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  40.11 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  40.88 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  40.11 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  41.57 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  41.88 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  38.67 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  39.66 
 
 		 178 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  42.61 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  40.34 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  46.67 
 
 		 172 aa  105  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  37.64 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  39.78 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  37.57 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  36.52 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  32.09 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  32.09 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  37.78 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  45.3 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  41.08 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  45.3 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  45.3 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  45.3 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  45.3 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  45.3 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  35.23 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  45.3 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  37.91 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  37.43 
 
 		 420 aa  99.4  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  35.91 
 
 		 191 aa  98.6  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  37.02 
 
 		 184 aa  98.2  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  37.91 
 
 		 421 aa  97.8  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  35.42 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0583  cytochrome B561  39.34 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  39.36 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  36.72 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  44.63 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  39.44 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  37.37 
 
 		 190 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  31.58 
 
 		 173 aa  96.3  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  34.46 
 
 		 179 aa  96.3  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  43.01 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  36.16 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  35.52 
 
 		 183 aa  95.1  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  34.55 
 
 		 187 aa  95.1  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  37.57 
 
 		 179 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  34.52 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  36.52 
 
 		 175 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  32.07 
 
 		 189 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  34.97 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  35.71 
 
 		 183 aa  92  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  37.36 
 
 		 176 aa  92  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2955  cytochrome B561  39.01 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  34.97 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  39.01 
 
 		 183 aa  91.3  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  34.97 
 
 		 183 aa  91.3  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1066  cytochrome B561  43.5 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  40.12 
 
 		 177 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  36.21 
 
 		 176 aa  89  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  40 
 
 		 177 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  36.87 
 
 		 185 aa  88.2  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  38.01 
 
 		 176 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  35.03 
 
 		 183 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  34.46 
 
 		 183 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  39.89 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  38.01 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  33.9 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  37.06 
 
 		 174 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  33.9 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  37.06 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  34.44 
 
 		 183 aa  86.3  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  33.92 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>