More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2410 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 		 433 aa  863    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  58.56 
 
 		 430 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  56.19 
 
 		 429 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  55.42 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  54.52 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  54.22 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  53.04 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  53.16 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  54.21 
 
 		 432 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  54.3 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  52.18 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  53.25 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  53.72 
 
 		 439 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  52.48 
 
 		 430 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  54.05 
 
 		 435 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  53.81 
 
 		 430 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  53.81 
 
 		 430 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  50.5 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  52.58 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  53.56 
 
 		 448 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  51.44 
 
 		 418 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  50.37 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  49.38 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  51.51 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  45.3 
 
 		 423 aa  360  4e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  51.11 
 
 		 422 aa  358  9e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  45.99 
 
 		 434 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6159  natural resistance-associated macrophage protein  50.48 
 
 		 447 aa  343  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  46.45 
 
 		 423 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  46.45 
 
 		 423 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  44.78 
 
 		 420 aa  332  9e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6380  natural resistance-associated macrophage protein  42.89 
 
 		 450 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455308  normal  0.342343 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  46.32 
 
 		 438 aa  316  7e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6056  natural resistance-associated macrophage protein  42.26 
 
 		 430 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.093688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1365  natural resistance-associated macrophage protein  42.26 
 
 		 430 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.715588  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6464  natural resistance-associated macrophage protein  42.26 
 
 		 430 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3145  putative transporter  44.12 
 
 		 487 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3016  putative transporter  43.88 
 
 		 484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5461  natural resistance-associated macrophage protein  41.62 
 
 		 434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  41.22 
 
 		 420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5632  natural resistance-associated macrophage protein  40.66 
 
 		 379 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0218907  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5256  natural resistance-associated macrophage protein  38.69 
 
 		 409 aa  259  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1365  putative transport related, membrane protein  41.56 
 
 		 382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  37.56 
 
 		 433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  32.91 
 
 		 415 aa  223  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  31.72 
 
 		 432 aa  206  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  33.77 
 
 		 452 aa  195  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  30.37 
 
 		 418 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  28.16 
 
 		 432 aa  183  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  30.05 
 
 		 408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  28.04 
 
 		 432 aa  176  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  28.93 
 
 		 415 aa  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  29.11 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4098  manganese transporter NRAMP  28.42 
 
 		 419 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  26.32 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  26.96 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  27.03 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  27.66 
 
 		 422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  26.24 
 
 		 419 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  30.12 
 
 		 419 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  28.02 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  27.46 
 
 		 425 aa  107  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  27.49 
 
 		 544 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  29.22 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  26.79 
 
 		 401 aa  103  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  26.1 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  26.16 
 
 		 434 aa  99.8  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  24.81 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  23.28 
 
 		 397 aa  99.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  26.09 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  25 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  27.18 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  25.06 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  26.78 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  26.09 
 
 		 442 aa  96.3  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  27.46 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  27.46 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  27.46 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  26.88 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.88 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  27.46 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  26.88 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  26.88 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  26.88 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  26.88 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  26.88 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  26.88 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  26.88 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  27.46 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  27.63 
 
 		 448 aa  94.7  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.97 
 
 		 439 aa  93.6  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  24.06 
 
 		 442 aa  93.2  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  26.64 
 
 		 463 aa  93.2  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  29.64 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  29.64 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  29.64 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  27.88 
 
 		 421 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  27.88 
 
 		 421 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  29.64 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  29.64 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>