More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2095 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  100 
 
 		 203 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  66.48 
 
 		 191 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  66.11 
 
 		 185 aa  237  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  65 
 
 		 186 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  64.25 
 
 		 187 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  62.78 
 
 		 205 aa  218  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  62.78 
 
 		 205 aa  218  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  60.66 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  56.7 
 
 		 190 aa  204  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  58.89 
 
 		 190 aa  202  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  58.99 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  54.64 
 
 		 189 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  57.38 
 
 		 205 aa  194  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  54.64 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  51.91 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  62.76 
 
 		 154 aa  175  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  51.98 
 
 		 186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  47.54 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  48.15 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  42.39 
 
 		 196 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  42.39 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  49.72 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  42.39 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  41.85 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  41.85 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  42.22 
 
 		 198 aa  134  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  46.99 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  45.81 
 
 		 183 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  45.3 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  44.2 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  46.45 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  46.45 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  46.45 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  41.08 
 
 		 183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  39.89 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  41.62 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  46.93 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  42.13 
 
 		 191 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  42.13 
 
 		 191 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  43.96 
 
 		 185 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  39.89 
 
 		 185 aa  127  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  38.1 
 
 		 201 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  36.08 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  44.81 
 
 		 182 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  43.82 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  40.1 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  40.11 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.8 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  40.33 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  45.83 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  38.8 
 
 		 185 aa  121  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  38.8 
 
 		 185 aa  121  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 		 201 aa  121  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  41.95 
 
 		 199 aa  121  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  35.29 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  35.29 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  37.43 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  35.68 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  40.21 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  40.21 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  40.21 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  36.9 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  42.13 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  40.76 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  39.56 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  37.43 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  39.68 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 		 183 aa  115  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  37.95 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  37.43 
 
 		 196 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  37.91 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  38.3 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  34.55 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  36.26 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  37.93 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  35.52 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  35.2 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 193 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  38.55 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 		 195 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 184 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  36.32 
 
 		 307 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  36.32 
 
 		 307 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 		 191 aa  111  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  37.16 
 
 		 186 aa  111  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  38.59 
 
 		 201 aa  111  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  38.25 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  37.63 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  38.83 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  37.7 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  32.98 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  40.54 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>