74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1565 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 146 aa  274  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  55.56 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  62.04 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  62.04 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  63.57 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  60.58 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.49 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.32 
 
 		 143 aa  161  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  61.59 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  60.58 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.58 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  54.86 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  62.96 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.22 
 
 		 145 aa  151  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  56.74 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.39 
 
 		 145 aa  150  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  55.71 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  52.9 
 
 		 140 aa  146  9e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  66.67 
 
 		 145 aa  144  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  62.77 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  59.59 
 
 		 146 aa  140  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  58.7 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  58.7 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  58.7 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  65.74 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.58 
 
 		 145 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.51 
 
 		 138 aa  130  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  61.34 
 
 		 142 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  130  7.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  47.01 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  57.04 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  59.66 
 
 		 142 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  44.12 
 
 		 293 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.8 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.76 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.26 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.59 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  48.23 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.51 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.86 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.81 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.25 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.88 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.32 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.6 
 
 		 287 aa  104  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.85 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.81 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  43.57 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  42.86 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  42.86 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  42.86 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  42.86 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  42.86 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  42.86 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  42.86 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  41.13 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  41.13 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  42.86 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  42.86 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  40.43 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  40.71 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  38.76 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.8 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  37.4 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.47 
 
 		 298 aa  50.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1359  hypothetical protein  30.25 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  28.28 
 
 		 305 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.61 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.06 
 
 		 273 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  46 
 
 		 285 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  46 
 
 		 285 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>