42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1326 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1326  flagellar accessory protein FlaH  100 
 
 		 227 aa  455  1e-127  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0186854  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0129  flagellar accessory protein FlaH  62.01 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1863  flagellar accessory protein FlaH  33.19 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1343  flagellar accessory protein FlaH  32.75 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0124869  normal  0.27777 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0351  flagellar accessory protein FlaH  31.74 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0950  flagellar accessory protein FlaH  30.13 
 
 		 247 aa  132  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0103  flagellar accessory protein FlaH  29.69 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1966  flagellar accessory protein FlaH  30.57 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0947  flagellar accessory protein FlaH  31.47 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.316996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0998  flagellar accessory protein FlaH  31.9 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.753436  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1573  ATPase  28.63 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0974  flagellar accessory protein FlaH  31.44 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.281333  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2567  AAA ATPase  28.18 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1733  flagellar accessory protein FlaH  30.17 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0266  flagellar accessory protein FlaH  30.97 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.381064  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0231  flagella-related protein H  27.43 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0959  flagella-related protein H  25.66 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1319  AAA ATPase  26.05 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0347852  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2873  AAA ATPase  26.22 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.859778  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3413  ATPase involved in biogenesis of flagella-like protein  23.01 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  35.53 
 
 		 267 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  29.66 
 
 		 484 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  36.62 
 
 		 277 aa  49.7  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3108  hypothetical protein  27.74 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10072  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  34.21 
 
 		 267 aa  49.3  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  31.33 
 
 		 286 aa  48.9  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  32.53 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  34.21 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  31.33 
 
 		 281 aa  47  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  31.33 
 
 		 283 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  29.58 
 
 		 293 aa  46.2  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  29.91 
 
 		 518 aa  45.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  26.56 
 
 		 574 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3110  hypothetical protein  27.07 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  26.76 
 
 		 506 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  31.33 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  31.33 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  26.72 
 
 		 402 aa  42.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  33.33 
 
 		 344 aa  42.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  37.88 
 
 		 532 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  26.51 
 
 		 285 aa  42.4  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  26.5 
 
 		 565 aa  42  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>