More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0483 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0483  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  100 
 
 
383 aa  764    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.938147  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0902  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.15 
 
 
393 aa  526  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.164909  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1999  alcohol dehydrogenase  39.36 
 
 
395 aa  232  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0396672  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2206  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.13 
 
 
405 aa  230  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2111  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.78 
 
 
403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4169  alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
420 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.235444  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2251  alcohol dehydrogenase  36.63 
 
 
415 aa  199  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1431  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.48 
 
 
400 aa  189  5e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.115342  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0697  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.1 
 
 
408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1324  alcohol dehydrogenase  34.17 
 
 
407 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2277  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 
382 aa  125  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.00000000419237  hitchhiker  0.000159352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  32.71 
 
 
345 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.3 
 
 
339 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  26.56 
 
 
327 aa  106  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1823  alcohol dehydrogenase  30.27 
 
 
350 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00496203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.94 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.11 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
336 aa  96.3  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.18 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14560  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  26.38 
 
 
352 aa  94  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0972559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0343  alcohol dehydrogenase  30.73 
 
 
312 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472318 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2227  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  26.36 
 
 
346 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6089  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.4 
 
 
337 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  29.48 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  25.91 
 
 
337 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  25.34 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  28.3 
 
 
340 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02017  galactitol-1-phosphate dehydrogenase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  26.07 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  26.07 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1567  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.07 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0173762  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3070  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  26.07 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862081  hitchhiker  0.00000818535 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2379  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  26.07 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  26.4 
 
 
344 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01983  hypothetical protein  26.07 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0973  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  26.36 
 
 
346 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.465963 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.52 
 
 
347 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  26.5 
 
 
338 aa  90.5  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.93 
 
 
347 aa  90.5  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1147  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  26.07 
 
 
346 aa  90.1  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.52 
 
 
341 aa  90.1  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  28.12 
 
 
339 aa  89.4  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  25.14 
 
 
349 aa  89  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2116  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.82 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796302 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.46 
 
 
343 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.67 
 
 
329 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0834  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  23.8 
 
 
319 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  26.61 
 
 
343 aa  87  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.14 
 
 
335 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.83 
 
 
340 aa  87  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1003  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.48 
 
 
342 aa  86.7  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.124693 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.07 
 
 
340 aa  86.7  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.93 
 
 
336 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.85 
 
 
351 aa  86.7  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4352  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.11 
 
 
336 aa  86.3  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  25.19 
 
 
348 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4137  alcohol dehydrogenase  29.03 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.31521  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.81 
 
 
325 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.64 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0771  alcohol dehydrogenase  28.35 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4106  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.76 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.82135  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.75 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  27.22 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3519  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  27.59 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3450  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  27.56 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.49 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000121162  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3448  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  27.59 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  24.6 
 
 
345 aa  84  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.29 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.7 
 
 
341 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  27.59 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  26.32 
 
 
343 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  24.57 
 
 
318 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  27.36 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.36 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.36 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  27.36 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27 
 
 
340 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27 
 
 
340 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  26.11 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  24.07 
 
 
338 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.36 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.16 
 
 
337 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  26.71 
 
 
340 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3221  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  22.51 
 
 
358 aa  82.4  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000142115  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01090  xylitol dehydrogenase, putative  28.2 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3616  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  27.3 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.53 
 
 
336 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  26.69 
 
 
338 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1949  alcohol dehydrogenase  28.19 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0237239  hitchhiker  9.46914e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2531  alcohol dehydrogenase  25.99 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1079  alcohol dehydrogenase  22.02 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.12 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.36 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.55 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  28.75 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1179  alcohol dehydrogenase  25.2 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  25.35 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0246  alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000123303  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0087  alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>