More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6074 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6074  nickel transporter permease NikC  100 
 
 
283 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7616  nickel transporter permease NikC  56.58 
 
 
291 aa  316  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0802  nickel transporter permease NikC  61.69 
 
 
290 aa  311  5.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0752  nickel transporter permease NikC  61.69 
 
 
290 aa  310  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2275  nickel transporter permease NikC  61.51 
 
 
299 aa  291  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0126063  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3677  nickel transporter permease NikC  58.44 
 
 
277 aa  288  9e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3762  nickel transporter permease NikC  58.02 
 
 
277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03327  nickel transporter subunit  58.02 
 
 
277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0237  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  58.02 
 
 
277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0238  nickel transporter permease NikC  58.02 
 
 
277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3962  nickel transporter permease NikC  58.02 
 
 
277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4818  nickel transporter permease NikC  58.02 
 
 
277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03280  hypothetical protein  58.02 
 
 
277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3843  nickel transporter permease NikC  57.61 
 
 
277 aa  285  5e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.37 
 
 
373 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1836  nickel transporter permease NikC  57.68 
 
 
277 aa  281  8.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660391 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1030  nickel transporter permease NikC  56.22 
 
 
270 aa  275  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.503674  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3007  nickel transporter permease NikC  64.02 
 
 
281 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.524853 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1323  nickel transporter permease NikC  50 
 
 
277 aa  264  1e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00536272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0349  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  47.76 
 
 
283 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3344  nickel transporter permease NikC  62.96 
 
 
281 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.64 
 
 
287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.144364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  45.9 
 
 
284 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.16 
 
 
309 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0470  nickel ABC transporter, permease protein  43.64 
 
 
290 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.540099 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  42.29 
 
 
282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.661918 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  43.43 
 
 
279 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 
284 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1282  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.49 
 
 
300 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284613  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
309 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
292 aa  202  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000142566  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.95 
 
 
305 aa  202  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186771  normal  0.317689 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0275  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.99 
 
 
283 aa  202  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.609618  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.06 
 
 
300 aa  202  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.94 
 
 
309 aa  202  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
295 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.37 
 
 
287 aa  201  9e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.64 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0022  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  41.02 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  38.1 
 
 
299 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  38.1 
 
 
299 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  38.1 
 
 
299 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  38.1 
 
 
299 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  38.1 
 
 
299 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 
300 aa  198  7.999999999999999e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.23044 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2370  peptide ABC transporter, permease protein  39.37 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.75 
 
 
289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.75 
 
 
289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696968  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.07 
 
 
310 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362913 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.32 
 
 
301 aa  195  8.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.9 
 
 
301 aa  195  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.76 
 
 
310 aa  194  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
296 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.12 
 
 
301 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.70134 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 
310 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.72 
 
 
301 aa  192  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 
304 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.72 
 
 
311 aa  192  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.98 
 
 
300 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7518  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  39.02 
 
 
295 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0791708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0643  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.8 
 
 
292 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.43 
 
 
292 aa  190  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273251  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.57 
 
 
285 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  41.76 
 
 
300 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
294 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.76 
 
 
300 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.342595  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  38.83 
 
 
288 aa  188  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2848  ABC transporter permease protein  40.79 
 
 
276 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.19 
 
 
300 aa  188  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 
469 aa  187  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
304 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  41.24 
 
 
301 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.52 
 
 
296 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.232197  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.62 
 
 
319 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.96 
 
 
286 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2030  ABC transporter, permease protein  40.08 
 
 
300 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.749678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2115  peptide ABC transporter membrane protein  45 
 
 
286 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2680  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.84 
 
 
290 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129024  normal  0.890863 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 
305 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58779  normal  0.456296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3250  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC, putative  42.23 
 
 
301 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193894  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
298 aa  186  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0103943  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
300 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0620007  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.98 
 
 
300 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.284254  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
291 aa  186  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2358  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.48 
 
 
325 aa  186  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0041111  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2053  peptide ABC transporter permease  44.66 
 
 
303 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.942235  normal  0.455607 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.34 
 
 
303 aa  186  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.07 
 
 
303 aa  185  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
303 aa  185  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  40.07 
 
 
303 aa  185  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5359  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  43.4 
 
 
289 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.632265  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.71 
 
 
303 aa  185  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.71 
 
 
303 aa  185  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.71 
 
 
303 aa  185  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
299 aa  185  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.450042  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.71 
 
 
303 aa  185  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>