86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4455 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  100 
 
 		 131 aa  246  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  77.1 
 
 		 127 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  70.99 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  71.76 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  56.49 
 
 		 112 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2095  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2135  hypothetical protein  48.55 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365647  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2412  hypothetical protein  47.1 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0740  CsbD family protein  47.01 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  38.98 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  38.98 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  37.7 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1731  CsbD-like  36.07 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.888491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1037  CsbD-like protein  38.71 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.450936  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  35.09 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  37.29 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  37.29 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  34.48 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  35.09 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  28.05 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  42.86 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  44.44 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  41.07 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0795  CsbD family protein  40.68 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  38.18 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  36.84 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  36.36 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  36.36 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  37.5 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0240  CsbD family protein  45.45 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.9917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  36.36 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  39.29 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  36.67 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2910  hypothetical protein  43.64 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.912456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  35.71 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  34.38 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0249  putative stress-response protein  38.18 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1575  CsbD-like  45.45 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  36.67 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  35.63 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  36.07 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2023  CsbD-like protein  40 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3681  CsbD family protein  36.67 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1940  CsbD family protein  40 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1855  CsbD family protein  40 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  31.48 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4008  CsbD-like  33.87 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0235729  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  44.44 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3505  CsbD-like  36.36 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00399435  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0848  CsbD family protein  40 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00395156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3468  CsbD family protein  40 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4053  CsbD family protein  40 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  30.83 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  29.85 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6005  hypothetical protein  34.33 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  30.23 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3610  CsbD family protein  31.25 
 
 		 66 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0252527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  37.04 
 
 		 65 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  37.74 
 
 		 58 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  35.19 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02853  hypothetical protein  41.82 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0515  putative stress-response protein  32.84 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2699  CsbD family protein  39.34 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.90696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3411  CsbD family protein  40 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1092  hypothetical protein  38.18 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0055  CsbD family protein  36.36 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587208 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5243  CsbD family protein  40 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03877  hypothetical protein  34.55 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5526  putative stress-response protein  34.55 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.289766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3983  putative stress-response protein  34.55 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216116 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4552  putative stress-response protein  34.55 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4507  putative stress-response protein  34.55 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03917  predicted stress response protein  34.55 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4598  putative stress-response protein  34.55 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4285  putative stress-response protein  34.55 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3948  CsbD family protein  34.55 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4432  putative stress-response protein  34.55 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000026393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4497  putative stress-response protein  34.55 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4634  putative stress-response protein  34.55 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.27716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4582  putative stress-response protein  34.55 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4583  putative stress-response protein  34.55 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.808019 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  33.33 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  35.71 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2250  hypothetical protein  38.18 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  32.53 
 
 		 109 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1771  CsbD family protein  37.31 
 
 		 77 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>