More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3726 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  100 
 
 
466 aa  915    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.05 
 
 
461 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:flavodoxin/nitric oxide synthase  49.81 
 
 
511 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0428  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.56 
 
 
526 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5636  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  47.17 
 
 
533 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.926538  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.03 
 
 
843 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.71 
 
 
850 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  50.85 
 
 
783 aa  364  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  46.04 
 
 
840 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.75 
 
 
842 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3992  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.5 
 
 
521 aa  363  4e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  46.04 
 
 
850 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  45.26 
 
 
850 aa  349  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.4 
 
 
849 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.04 
 
 
534 aa  343  5e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12370  sulfite reductase, NADPH flavoprotein alpha-component  43 
 
 
513 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.01 
 
 
885 aa  327  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.2 
 
 
892 aa  324  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.54 
 
 
840 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  40.85 
 
 
844 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.38 
 
 
844 aa  265  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.09 
 
 
850 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.59 
 
 
849 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  58.59 
 
 
822 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.57 
 
 
851 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.68 
 
 
735 aa  201  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4603  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.67 
 
 
323 aa  170  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1892  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.12 
 
 
730 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161647  normal  0.0178534 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4965  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.95 
 
 
730 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.969673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  44.24 
 
 
1403 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  44.7 
 
 
1401 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  44.87 
 
 
1400 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1784  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.15 
 
 
589 aa  150  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.108282 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  43.98 
 
 
1405 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2801  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.48 
 
 
582 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.310808  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  43.46 
 
 
588 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.46 
 
 
588 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  43.06 
 
 
1418 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  43.06 
 
 
1398 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  43.06 
 
 
1418 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  43.06 
 
 
1418 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  43.06 
 
 
1418 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  43.06 
 
 
1418 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  43.52 
 
 
1397 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  43.06 
 
 
1418 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  43.52 
 
 
1395 aa  146  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  44.76 
 
 
1257 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  41.86 
 
 
600 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  43.52 
 
 
1397 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  44.76 
 
 
1338 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  43.06 
 
 
1427 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0233  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32.05 
 
 
734 aa  142  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  39.34 
 
 
539 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  42.25 
 
 
1357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1598  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.58 
 
 
725 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.80614 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  40.08 
 
 
600 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  39.66 
 
 
612 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  42.59 
 
 
1395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  42.59 
 
 
1395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  42.59 
 
 
1395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  39.66 
 
 
600 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.67 
 
 
607 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.28 
 
 
600 aa  140  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
659 aa  140  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  41.78 
 
 
1383 aa  139  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  35.15 
 
 
626 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  41.31 
 
 
1341 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  35.15 
 
 
629 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  39.24 
 
 
1384 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  39.53 
 
 
623 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5389  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.72 
 
 
732 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.91 
 
 
739 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3213  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.91 
 
 
739 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5165  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase:oxidoreductase FAD-binding region  33.1 
 
 
736 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974018  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  40.93 
 
 
599 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  41.4 
 
 
609 aa  137  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  41.4 
 
 
609 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3436  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.83 
 
 
725 aa  136  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.129354  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  40.47 
 
 
599 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  40.38 
 
 
1313 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  40.47 
 
 
599 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  38.36 
 
 
969 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40 
 
 
599 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  40.28 
 
 
1407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  40 
 
 
599 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.6 
 
 
725 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.265737  normal  0.143832 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  40 
 
 
599 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  44.7 
 
 
1394 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3748  sulfite reductase  42.01 
 
 
540 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4232  sulfite reductase  39.27 
 
 
539 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  40.65 
 
 
1342 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.36 
 
 
736 aa  134  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180249  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  40 
 
 
599 aa  133  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  40 
 
 
599 aa  133  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  40 
 
 
599 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40 
 
 
599 aa  133  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  40 
 
 
599 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  40 
 
 
599 aa  133  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  40 
 
 
599 aa  133  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  38.6 
 
 
612 aa  133  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>