202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4603 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4603  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 
323 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:flavodoxin/nitric oxide synthase  37.38 
 
 
511 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0428  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.92 
 
 
526 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  41.67 
 
 
466 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5636  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  37.69 
 
 
533 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.926538  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12370  sulfite reductase, NADPH flavoprotein alpha-component  35.83 
 
 
513 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  33.55 
 
 
822 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3992  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.28 
 
 
521 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.02 
 
 
842 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  34.6 
 
 
783 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.92 
 
 
843 aa  149  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  32.69 
 
 
840 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.93 
 
 
461 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.97 
 
 
850 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 
885 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.55 
 
 
534 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  38.81 
 
 
850 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  32.57 
 
 
850 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  32.8 
 
 
844 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.86 
 
 
851 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.01 
 
 
850 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.01 
 
 
849 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.14 
 
 
849 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.66 
 
 
840 aa  126  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.03 
 
 
844 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.2 
 
 
892 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  29.72 
 
 
612 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.66 
 
 
600 aa  96.7  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  33.18 
 
 
1257 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2801  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.47 
 
 
582 aa  93.6  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.310808  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.64 
 
 
600 aa  92.8  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  29.03 
 
 
588 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.03 
 
 
588 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  31.84 
 
 
623 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  33.66 
 
 
1342 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.7 
 
 
1395 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  30.66 
 
 
614 aa  90.5  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  31.46 
 
 
659 aa  90.1  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  29.49 
 
 
628 aa  89.7  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  29.72 
 
 
631 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  31.63 
 
 
1395 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  31.63 
 
 
1395 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  30.66 
 
 
1338 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.76 
 
 
584 aa  87.4  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  30.7 
 
 
1397 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4232  sulfite reductase  30.32 
 
 
539 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  31.63 
 
 
1395 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  30.7 
 
 
1397 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  28.3 
 
 
613 aa  86.7  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  31.16 
 
 
1357 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.64 
 
 
607 aa  86.3  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  27.86 
 
 
614 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.32 
 
 
613 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  32.43 
 
 
1370 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  31.84 
 
 
883 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.77 
 
 
613 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.37 
 
 
629 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  30.7 
 
 
1341 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.37 
 
 
626 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  29.3 
 
 
1405 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  33.94 
 
 
1313 aa  83.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.83 
 
 
610 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  28.44 
 
 
612 aa  82.8  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  28.44 
 
 
600 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  30.84 
 
 
1400 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  30.08 
 
 
539 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  28.44 
 
 
600 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.19 
 
 
605 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2738  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.67 
 
 
726 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  29.91 
 
 
1418 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.3 
 
 
608 aa  80.1  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  29.63 
 
 
599 aa  80.1  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  29.21 
 
 
602 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3790  FAD-binding domain-containing protein  29.13 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  31.89 
 
 
1398 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.89 
 
 
1418 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.89 
 
 
1418 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  31.89 
 
 
1418 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  31.89 
 
 
1418 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.89 
 
 
1418 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  31.35 
 
 
1403 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  28.97 
 
 
1384 aa  79.7  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  28.95 
 
 
599 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  31.89 
 
 
1427 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  28.95 
 
 
599 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  28.95 
 
 
599 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.95 
 
 
599 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  28.95 
 
 
599 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  28.95 
 
 
599 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.12 
 
 
735 aa  79  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  28.95 
 
 
599 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  28.95 
 
 
599 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  28.42 
 
 
599 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  28.9 
 
 
599 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.81 
 
 
1401 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  28.95 
 
 
599 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  28.95 
 
 
599 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.44 
 
 
607 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1892  flavodoxin/nitric oxide synthase  33 
 
 
730 aa  77.4  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161647  normal  0.0178534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  28.95 
 
 
599 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>