138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1941 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  100 
 
 		 144 aa  292  8e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2409  DNA polymerase III subunit chi  50.7 
 
 		 145 aa  143  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.446453  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2168  DNA polymerase III subunit chi  49.3 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0875446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3637  DNA polymerase III subunit chi  48.23 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2117  DNA polymerase III subunit chi  44.37 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0985  DNA polymerase III subunit chi  48.23 
 
 		 138 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0829  DNA polymerase III subunit chi  47.22 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.525292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0745  DNA polymerase III chi subunit, HolC  41.96 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.753041  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2731  DNA polymerase III subunit chi  42.36 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.480255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3083  DNA polymerase III chi subunit, HolC  42.03 
 
 		 140 aa  113  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2594  DNA polymerase III chi subunit HolC  43.36 
 
 		 145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0673  DNA polymerase III subunit chi  47.92 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.813274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1177  DNA polymerase III subunit chi  47.92 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2338  DNA polymerase III subunit chi  47.92 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2948  DNA polymerase III subunit chi  47.92 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1016  DNA polymerase III subunit chi  47.92 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.253766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1023  DNA polymerase III subunit chi  47.92 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320715  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1652  DNA polymerase III subunit chi  47.92 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.291521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0824  DNA polymerase III subunit chi  47.92 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2806  DNA polymerase III subunit chi  45.07 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.654553  normal  0.315604 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1854  DNA polymerase III subunit chi  48.61 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2465  DNA polymerase III subunit chi  48.61 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2470  DNA polymerase III subunit chi  48.61 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3540  DNA polymerase III chi subunit HolC  43.36 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0579  DNA polymerase III, chi subunit  42.66 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.706687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2514  DNA polymerase III subunit chi  47.52 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2382  DNA polymerase III subunit chi  47.52 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3161  DNA polymerase III chi subunit, HolC  44.76 
 
 		 144 aa  105  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2682  DNA polymerase III subunit chi  43.66 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0568608  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5796  DNA polymerase III subunit chi  46.81 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0223  DNA polymerase III, chi subunit  37.5 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000247187  normal  0.861586 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1922  DNA polymerase III chi subunit, HolC  39.16 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.127132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4921  DNA polymerase III chi subunit, HolC  44.06 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1726  DNA polymerase III chi subunit HolC  39.16 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2414  DNA polymerase III subunit chi  44.83 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2218  DNA polymerase III subunit chi  47.59 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2224  DNA polymerase III subunit chi  43.97 
 
 		 138 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.534333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2678  DNA polymerase III subunit chi  46.9 
 
 		 142 aa  97.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0288  DNA polymerase III chi subunit, HolC  33.56 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696514  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2141  DNA polymerase III chi subunit HolC  36.99 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2788  DNA polymerase III chi subunit HolC  39.13 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2116  DNA polymerase III chi subunit HolC  36.05 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2098  DNA polymerase III, chi subunit, putative  36.03 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0624  DNA polymerase III chi subunit, HolC  33.77 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161546  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4238  DNA polymerase III subunit chi  32.65 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0979  DNA polymerase III subunit chi  32.65 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2921  DNA polymerase III chi subunit, HolC  31.76 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171955  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1017  DNA polymerase III subunit chi  32.65 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0985  DNA polymerase III subunit chi  31.97 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14460  DNA polymerase III subunit chi  31.51 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1232  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.79 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1270  DNA polymerase III, chi subunit  32.65 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1281  DNA polymerase III subunit chi  31.51 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0988  DNA polymerase III subunit chi  32.43 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1749  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.13 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1371  DNA polymerase III, chi subunit  33.56 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.217758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0682  DNA polymerase III chi subunit, HolC  34.92 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.237318  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1090  DNA polymerase III subunit chi  31.97 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11640  DNA polymerase III subunit chi  30.82 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3423  DNA polymerase III, chi subunit  28.79 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0960  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.91 
 
 		 169 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2866  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.66 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0418858  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2741  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.57 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.464581  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1202  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.27 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1132  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.78 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00137495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  34.9 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1131  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.98 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000927432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0112  DNA polymerase III subunit chi  29.23 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0096  DNA polymerase III subunit chi  29.23 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1264  DNA polymerase III subunit chi  27.56 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000426106  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0917  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.81 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.741831  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0052  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.32 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  30.43 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  34.53 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  33.09 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3833  DNA polymerase III subunit chi  34.75 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  33.09 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  34.04 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0557  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.43 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  33.09 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2557  hypothetical protein  24.6 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3111  DNA polymerase III chi subunit HolC  25.98 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00130972  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3120  DNA polymerase III chi subunit HolC  25.98 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000377435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3263  DNA polymerase III chi subunit HolC  25.98 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1256  DNA polymerase III chi subunit HolC  25.98 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00560451  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1459  DNA polymerase III chi subunit HolC  34.62 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  31.76 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3528  DNA polymerase III, chi subunit  34.4 
 
 		 139 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0021621  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2685  hypothetical protein  24.6 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  31.21 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  29.87 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0535  DNA polymerase III subunit chi  29.55 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.815318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0902  DNA polymerase III chi subunit HolC  25.2 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0739  DNA polymerase III, chi subunit  25.95 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1009  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.19 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  30.22 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2338  DNA polymerase III subunit chi  34.51 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.65 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  32.61 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0791  DNA polymerase III, chi subunit  32.26 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>