More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8658 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8658  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 434 aa  831    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36120  putative MFS transporter  59.3 
 
 		 441 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3079  MFS family transporter  58.14 
 
 		 441 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  49.41 
 
 		 432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  49.41 
 
 		 433 aa  401  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4280  major facilitator superfamily MFS_1  49.08 
 
 		 439 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  47.97 
 
 		 431 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  40.96 
 
 		 442 aa  329  7e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4063  major facilitator transporter  44.83 
 
 		 452 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  36.74 
 
 		 448 aa  219  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 435 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  37.26 
 
 		 443 aa  203  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  33.58 
 
 		 448 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 463 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 469 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 447 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 479 aa  199  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 463 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 463 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.57 
 
 		 456 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 450 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  34.39 
 
 		 436 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  34.55 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 449 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 431 aa  193  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  32.02 
 
 		 459 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  35.11 
 
 		 434 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  31.32 
 
 		 485 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  31.53 
 
 		 485 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  33.33 
 
 		 430 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 446 aa  190  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 467 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  33.25 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 455 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  32.92 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  32.6 
 
 		 451 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  32.1 
 
 		 458 aa  186  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  32.43 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  32.43 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  32.43 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  33.33 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  32.43 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  31.03 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  33.33 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  32.43 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  32.43 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  32.43 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  33.87 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  33.87 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  33.87 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  33.33 
 
 		 432 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  34.24 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  31.03 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  31.03 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  31.03 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  31.03 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  31.03 
 
 		 453 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  31.03 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  31.03 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  31.03 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  34.27 
 
 		 478 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 425 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  32.42 
 
 		 449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  33.87 
 
 		 428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  31.65 
 
 		 450 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  33.33 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  33.33 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  33.33 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  32.17 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  33.33 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  33.33 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  30.35 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  33.33 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  33.33 
 
 		 430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  31.36 
 
 		 450 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  32.82 
 
 		 430 aa  179  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0530  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 419 aa  179  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.649609  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  30.94 
 
 		 453 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3044  D-galactonate transporter  30.89 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5322  d-galactonate transporter  30.89 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  29.51 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3978  putative glucarate transporter  30.08 
 
 		 436 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.776069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  30.08 
 
 		 436 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3916  probable glucarate transporter  30.08 
 
 		 436 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  28.74 
 
 		 447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>