More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7928 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_7928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
322 aa  640    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2109  putative UDP-glucose 4-epimerase  34.38 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
336 aa  99.4  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0223  putative nucleotide sugar epimerase  30.58 
 
 
340 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  29.77 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
335 aa  92.8  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 
321 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 
332 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0191  putative nucleotide sugar epimerase  27.39 
 
 
339 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.068357  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0618  oligopeptide transporter OPT  25.63 
 
 
335 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241656  normal  0.415847 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25381  putative nucleotide sugar epimerase  27.5 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.19 
 
 
336 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.64 
 
 
338 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 
335 aa  86.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1471  nucleotide sugar epimerase  28.57 
 
 
323 aa  86.3  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.83 
 
 
337 aa  85.9  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  25.38 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.19 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445777 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
323 aa  85.9  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0209  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.71 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.52 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 
340 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0609  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.51 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.63 
 
 
336 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.15 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0025  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.730827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
335 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.19 
 
 
336 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
335 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.11 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.71 
 
 
345 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2449  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  28.15 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0862725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26.02 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.6 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.61 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0115301  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.974335  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.411668  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1681  putative nucleotide sugar epimerase  25.31 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.174267  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0796  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.02 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.47 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 
324 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.82 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.96 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
325 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03951  putative nucleotide sugar epimerase  25.31 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.658541  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0496  UDP-glucuronate 5'-epimerase  23.26 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.53 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1400  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  26.05 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1106  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01321  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  24.07 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2241  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  25.85 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2638  UDP-glucuronate 5'-epimerase  27.43 
 
 
336 aa  77  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.165697  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.95 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  25.32 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2598  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
358 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0909  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  24.8 
 
 
339 aa  77  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25 
 
 
318 aa  77  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
325 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.850459  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>