86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6972 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6972  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 195 aa  383  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6286  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  95.9 
 
 		 195 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.969042  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3527  two component response regulator  42.68 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2605  two component transcriptional regulator  42.68 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2174  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3488  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.487721  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3079  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3336  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.523001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1026  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0824  response regulator receiver  43.84 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6127  two component transcriptional regulator  41.25 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0784  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.84 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1508  cell cycle transcriptional regulator ctrA  42.47 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_002978  WD0732  cell cycle transcriptional regulator  45.31 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1830  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2213  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  41.25 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0669  transcription regulator CtrA  43.84 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0747  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.47 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  0.934966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3622  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.47 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0114155  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1019  cell cycle transcriptional regulator CtrA  41.1 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.736916  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5573  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3946  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.26309  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0344  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0563  two component transcriptional regulator  37.11 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.621979  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0303  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1903  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1279  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.461363  normal  0.257738 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2505  two component transcriptional regulator  41.77 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791438  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2621  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75303  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2529  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.47 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4854  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3672  winged helix family two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0525  transcriptional regulatory protein  42.47 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369528  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4233  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0736222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1822  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.47 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.077619  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3371  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.442318  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3912  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6533  cell cycle transcriptional regulator CtrA  42.47 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1569  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1599  cell cycle transcriptional regulator CtrA  40 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0525  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  42.86 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1399  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1542  cell cycle transcriptional regulator CtrA  40 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5319  cell cycle transcriptional regulator CtrA  43.94 
 
 		 233 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983847 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0234  DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 265 aa  52  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0574  two component transcriptional regulator  35.44 
 
 		 250 aa  52  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.821306  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0817  response regulator receiver: C terminal  32.47 
 
 		 266 aa  50.4  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0415499  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1012  DNA-binding response regulator  32.47 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0213425  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1202  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3447  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 		 266 aa  48.5  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.652082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1393  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.16 
 
 		 223 aa  48.5  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0533398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2647  response regulator receiver domain-containing protein  43.24 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3142  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 245 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6599  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 		 224 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657401 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1494  response regulator receiver domain-containing protein  40.24 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0630  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000549408  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4084  response regulator receiver protein  53.85 
 
 		 57 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579034  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1754  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  41.89 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0977  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.08 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.09 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3060  two component transcriptional regulator  43.06 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1059  two component transcriptional regulator  36.08 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.346912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1953  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  41.98 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2872  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000541059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0003  response regulator receiver  34.62 
 
 		 235 aa  42.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3274  transcriptional regulator OmpR, putative  37.5 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0331967  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0242  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  33.59 
 
 		 249 aa  42.4  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0496  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  36.71 
 
 		 235 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3958  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 237 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4036  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0545  two component transcriptional regulator  40.24 
 
 		 250 aa  42  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  36.71 
 
 		 235 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1039  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 222 aa  42  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0126  GcrA cell cycle regulator  38.89 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2746  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 233 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396444  normal  0.898138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5796  GcrA cell cycle regulator  46.15 
 
 		 172 aa  41.6  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1083  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 233 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 240 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  37.66 
 
 		 288 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1544  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 237 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4040  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 		 232 aa  41.2  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>