44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5796 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5796  GcrA cell cycle regulator  100 
 
 		 172 aa  347  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7422  GcrA cell cycle regulator  35.33 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4194  GcrA cell cycle regulator  35.17 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4709  GcrA cell cycle regulator  34.46 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0264058  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1228  GcrA cell cycle regulator  36.81 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0613007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5831  hypothetical protein  32.08 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.594527  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5186  GcrA cell cycle regulator  33.94 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4719  GcrA cell cycle regulator  33.94 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5258  GcrA cell cycle regulator  32.32 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0662  GcrA cell cycle regulator  27.23 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6684  GcrA cell cycle regulator  33.13 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4917  GcrA cell cycle regulator  30.12 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0782  GcrA cell cycle regulator  28.82 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0758  global cell cycle regulator GcrA  29.27 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  0.136317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0894  GcrA cell cycle regulator  30.41 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0641  GcrA cell cycle regulator  29.27 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0400  GcrA cell cycle regulator  28.05 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.800641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1217  GcrA cell cycle regulator  29.7 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5260  GcrA cell cycle regulator  29.82 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980946  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3361  GcrA cell cycle regulator  30 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513155  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2616  putative gcrA cell cycle regulator  26.73 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.374735  hitchhiker  0.00797611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0485  global cell cycle regulator GcrA  30.32 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0512  GcrA cell cycle regulator  28.07 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.711228  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1020  GcrA cell cycle regulator  27.46 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0313  hypothetical protein  30.17 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0299  hypothetical protein  30.17 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3104  GcrA cell cycle regulator  26.5 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0886192  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0393  GcrA cell cycle regulator  26.7 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0126  GcrA cell cycle regulator  28.24 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3075  GcrA cell cycle regulator  30.26 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3667  GcrA cell cycle regulator  31.07 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1656  hypothetical protein  31.21 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.0000870155  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1289  GcrA cell cycle regulator  25.29 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2169  GcrA cell cycle regulator  29.94 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.323793  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0184  GcrA cell cycle regulator  27.06 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.624158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0484  hypothetical protein  26.7 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0833  GcrA cell cycle regulator  36.36 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00984482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0174  GcrA cell cycle regulator  26.32 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4617  hypothetical protein  29.22 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0010  global cell cycle regulator GcrA  24.57 
 
 		 202 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3377  GcrA cell cycle regulator  25.9 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4580  GcrA cell cycle regulator  34.12 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5173  GcrA cell cycle regulator  28 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6972  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 195 aa  40.8  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>