50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5260 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5260  GcrA cell cycle regulator  100 
 
 		 169 aa  350  5e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0782  GcrA cell cycle regulator  95.27 
 
 		 169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0894  GcrA cell cycle regulator  91.12 
 
 		 170 aa  325  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4917  GcrA cell cycle regulator  88.76 
 
 		 169 aa  317  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0641  GcrA cell cycle regulator  86.83 
 
 		 168 aa  308  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0512  GcrA cell cycle regulator  83.83 
 
 		 168 aa  300  5.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.711228  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0758  global cell cycle regulator GcrA  84.62 
 
 		 171 aa  300  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  0.136317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1217  GcrA cell cycle regulator  58.96 
 
 		 174 aa  191  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3667  GcrA cell cycle regulator  52.75 
 
 		 189 aa  171  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0126  GcrA cell cycle regulator  55.75 
 
 		 187 aa  168  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0393  GcrA cell cycle regulator  50.55 
 
 		 179 aa  167  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6684  GcrA cell cycle regulator  52.41 
 
 		 175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0299  hypothetical protein  50.56 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0313  hypothetical protein  50.56 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7422  GcrA cell cycle regulator  49.4 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3361  GcrA cell cycle regulator  47.27 
 
 		 177 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513155  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1289  GcrA cell cycle regulator  46.89 
 
 		 179 aa  149  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4719  GcrA cell cycle regulator  46.15 
 
 		 179 aa  147  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5186  GcrA cell cycle regulator  46.15 
 
 		 179 aa  147  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5258  GcrA cell cycle regulator  44.85 
 
 		 179 aa  144  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0010  global cell cycle regulator GcrA  46.77 
 
 		 202 aa  143  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0184  GcrA cell cycle regulator  50.6 
 
 		 177 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.624158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0484  hypothetical protein  44.83 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0174  GcrA cell cycle regulator  47.02 
 
 		 177 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0485  global cell cycle regulator GcrA  47.31 
 
 		 177 aa  137  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3104  GcrA cell cycle regulator  41.29 
 
 		 205 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0886192  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0400  GcrA cell cycle regulator  51.59 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.800641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1228  GcrA cell cycle regulator  49.1 
 
 		 172 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0613007 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1020  GcrA cell cycle regulator  40.84 
 
 		 195 aa  127  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3377  GcrA cell cycle regulator  43.56 
 
 		 193 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0662  GcrA cell cycle regulator  41.24 
 
 		 196 aa  124  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0833  GcrA cell cycle regulator  39.02 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00984482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4194  GcrA cell cycle regulator  41.88 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4709  GcrA cell cycle regulator  40.85 
 
 		 130 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0264058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4617  hypothetical protein  39.74 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1656  hypothetical protein  36.42 
 
 		 122 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.0000870155  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3075  GcrA cell cycle regulator  32.92 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2169  GcrA cell cycle regulator  34.46 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.323793  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5173  GcrA cell cycle regulator  37.42 
 
 		 188 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2043  GcrA cell cycle regulator  68.42 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482667 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2007  hypothetical protein  77.08 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1094  GcrA cell cycle regulator  70.83 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0717  GcrA cell cycle regulator  77.08 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2616  putative gcrA cell cycle regulator  77.08 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.374735  hitchhiker  0.00797611 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2480  GcrA cell cycle regulator  65.45 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4580  GcrA cell cycle regulator  66.67 
 
 		 219 aa  73.9  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1309  GcrA cell cycle regulator  58.14 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5796  GcrA cell cycle regulator  27.44 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5831  hypothetical protein  28.22 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.594527  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0757  hypothetical protein  35.63 
 
 		 99 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.200451  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>