48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4719 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5186  GcrA cell cycle regulator  100 
 
 		 179 aa  361  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4719  GcrA cell cycle regulator  100 
 
 		 179 aa  361  3e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5258  GcrA cell cycle regulator  88.83 
 
 		 179 aa  310  4.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7422  GcrA cell cycle regulator  64.89 
 
 		 176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3361  GcrA cell cycle regulator  65.17 
 
 		 177 aa  208  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513155  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6684  GcrA cell cycle regulator  63.39 
 
 		 175 aa  201  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3667  GcrA cell cycle regulator  51.4 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0758  global cell cycle regulator GcrA  48.54 
 
 		 171 aa  160  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  0.136317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0641  GcrA cell cycle regulator  49.12 
 
 		 168 aa  158  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0512  GcrA cell cycle regulator  48.5 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.711228  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0782  GcrA cell cycle regulator  47.02 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4917  GcrA cell cycle regulator  46.75 
 
 		 169 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1217  GcrA cell cycle regulator  49.71 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5260  GcrA cell cycle regulator  46.15 
 
 		 169 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980946  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0894  GcrA cell cycle regulator  44.38 
 
 		 170 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0393  GcrA cell cycle regulator  44.13 
 
 		 179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1289  GcrA cell cycle regulator  45.25 
 
 		 179 aa  144  5e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0313  hypothetical protein  41.05 
 
 		 180 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0126  GcrA cell cycle regulator  45.35 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_004310  BR0299  hypothetical protein  41.05 
 
 		 180 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1228  GcrA cell cycle regulator  45.18 
 
 		 172 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0613007 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0485  global cell cycle regulator GcrA  45.66 
 
 		 177 aa  134  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0484  hypothetical protein  41.85 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0662  GcrA cell cycle regulator  40.82 
 
 		 196 aa  130  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3104  GcrA cell cycle regulator  40 
 
 		 205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0886192  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0184  GcrA cell cycle regulator  40.94 
 
 		 177 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.624158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0010  global cell cycle regulator GcrA  40.68 
 
 		 202 aa  127  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0400  GcrA cell cycle regulator  47.02 
 
 		 171 aa  127  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.800641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0174  GcrA cell cycle regulator  41.52 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1020  GcrA cell cycle regulator  38.42 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2616  putative gcrA cell cycle regulator  36.41 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.374735  hitchhiker  0.00797611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1094  GcrA cell cycle regulator  35.85 
 
 		 230 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3377  GcrA cell cycle regulator  37.79 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4194  GcrA cell cycle regulator  37.5 
 
 		 128 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4709  GcrA cell cycle regulator  37.65 
 
 		 130 aa  101  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0264058  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1656  hypothetical protein  33.73 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.0000870155  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3075  GcrA cell cycle regulator  37.89 
 
 		 162 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5173  GcrA cell cycle regulator  33.87 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2169  GcrA cell cycle regulator  36.84 
 
 		 175 aa  94.4  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.323793  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1309  GcrA cell cycle regulator  31.44 
 
 		 232 aa  91.7  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0833  GcrA cell cycle regulator  29.72 
 
 		 220 aa  88.6  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00984482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4617  hypothetical protein  32.76 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2007  hypothetical protein  42.39 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0717  GcrA cell cycle regulator  42.39 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2480  GcrA cell cycle regulator  42.86 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2043  GcrA cell cycle regulator  40.22 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4580  GcrA cell cycle regulator  38.1 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5796  GcrA cell cycle regulator  30.59 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>