48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0833 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0833  GcrA cell cycle regulator  100 
 
 
220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00984482 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3667  GcrA cell cycle regulator  50.23 
 
 
189 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1217  GcrA cell cycle regulator  43.18 
 
 
174 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0894  GcrA cell cycle regulator  41.1 
 
 
170 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0782  GcrA cell cycle regulator  40.64 
 
 
169 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5260  GcrA cell cycle regulator  41.55 
 
 
169 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980946  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4917  GcrA cell cycle regulator  40.47 
 
 
169 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0641  GcrA cell cycle regulator  40.27 
 
 
168 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0758  global cell cycle regulator GcrA  39.72 
 
 
171 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  0.136317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7422  GcrA cell cycle regulator  40.57 
 
 
176 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424183  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0299  hypothetical protein  36.52 
 
 
180 aa  131  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0313  hypothetical protein  36.52 
 
 
180 aa  131  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0393  GcrA cell cycle regulator  36.82 
 
 
179 aa  131  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6684  GcrA cell cycle regulator  39.15 
 
 
175 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0512  GcrA cell cycle regulator  39.45 
 
 
168 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.711228  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0126  GcrA cell cycle regulator  37.16 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5258  GcrA cell cycle regulator  38.32 
 
 
179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1228  GcrA cell cycle regulator  40 
 
 
172 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0613007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3104  GcrA cell cycle regulator  37.34 
 
 
205 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0886192  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1289  GcrA cell cycle regulator  34.86 
 
 
179 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0184  GcrA cell cycle regulator  37.62 
 
 
177 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.624158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0662  GcrA cell cycle regulator  35.19 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0174  GcrA cell cycle regulator  36.19 
 
 
177 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0484  hypothetical protein  34.29 
 
 
183 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4719  GcrA cell cycle regulator  33.79 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5186  GcrA cell cycle regulator  33.79 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0010  global cell cycle regulator GcrA  32.27 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3361  GcrA cell cycle regulator  63.33 
 
 
177 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513155  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3377  GcrA cell cycle regulator  28.71 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0485  global cell cycle regulator GcrA  58.06 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193907  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2169  GcrA cell cycle regulator  31.92 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.323793  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0400  GcrA cell cycle regulator  56.52 
 
 
171 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.800641  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1020  GcrA cell cycle regulator  68.52 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2043  GcrA cell cycle regulator  64.81 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482667 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2616  putative gcrA cell cycle regulator  67.31 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.374735  hitchhiker  0.00797611 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2007  hypothetical protein  51.79 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0717  GcrA cell cycle regulator  51.79 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3075  GcrA cell cycle regulator  43.66 
 
 
162 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4194  GcrA cell cycle regulator  50 
 
 
128 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16142  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1656  hypothetical protein  40 
 
 
122 aa  61.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.0000870155  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5173  GcrA cell cycle regulator  58.33 
 
 
188 aa  58.5  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588722  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4709  GcrA cell cycle regulator  50 
 
 
130 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0264058  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1309  GcrA cell cycle regulator  48.98 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473507  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2480  GcrA cell cycle regulator  43.4 
 
 
235 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4580  GcrA cell cycle regulator  44.9 
 
 
219 aa  55.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1094  GcrA cell cycle regulator  43.4 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4617  hypothetical protein  40.38 
 
 
159 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5796  GcrA cell cycle regulator  45.1 
 
 
172 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>