52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0485 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0485  global cell cycle regulator GcrA  100 
 
 
177 aa  358  3e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193907  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1228  GcrA cell cycle regulator  60.25 
 
 
172 aa  175  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0613007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0400  GcrA cell cycle regulator  55.42 
 
 
171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.800641  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5186  GcrA cell cycle regulator  49.41 
 
 
179 aa  157  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4719  GcrA cell cycle regulator  49.41 
 
 
179 aa  157  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1217  GcrA cell cycle regulator  50.29 
 
 
174 aa  155  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5258  GcrA cell cycle regulator  48.48 
 
 
179 aa  154  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7422  GcrA cell cycle regulator  49.11 
 
 
176 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6684  GcrA cell cycle regulator  48.81 
 
 
175 aa  151  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0758  global cell cycle regulator GcrA  51.55 
 
 
171 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  0.136317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0782  GcrA cell cycle regulator  51.88 
 
 
169 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4917  GcrA cell cycle regulator  51.88 
 
 
169 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5260  GcrA cell cycle regulator  51.57 
 
 
169 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980946  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3667  GcrA cell cycle regulator  46.67 
 
 
189 aa  147  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0641  GcrA cell cycle regulator  50.6 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0512  GcrA cell cycle regulator  49.7 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.711228  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0894  GcrA cell cycle regulator  51.85 
 
 
170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3361  GcrA cell cycle regulator  48.5 
 
 
177 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513155  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0126  GcrA cell cycle regulator  48.54 
 
 
187 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0313  hypothetical protein  45.51 
 
 
180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0299  hypothetical protein  45.51 
 
 
180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1289  GcrA cell cycle regulator  42.54 
 
 
179 aa  143  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0393  GcrA cell cycle regulator  47.22 
 
 
179 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0662  GcrA cell cycle regulator  44.44 
 
 
196 aa  140  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0010  global cell cycle regulator GcrA  47.19 
 
 
202 aa  137  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1020  GcrA cell cycle regulator  45.88 
 
 
195 aa  136  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0184  GcrA cell cycle regulator  45.51 
 
 
177 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.624158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0484  hypothetical protein  44.69 
 
 
183 aa  130  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0174  GcrA cell cycle regulator  46.71 
 
 
177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3104  GcrA cell cycle regulator  39.71 
 
 
205 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0886192  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2616  putative gcrA cell cycle regulator  38.54 
 
 
207 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.374735  hitchhiker  0.00797611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0833  GcrA cell cycle regulator  40.49 
 
 
220 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00984482 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3075  GcrA cell cycle regulator  42 
 
 
162 aa  120  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4194  GcrA cell cycle regulator  40.65 
 
 
128 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16142  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4709  GcrA cell cycle regulator  40.79 
 
 
130 aa  110  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0264058  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2169  GcrA cell cycle regulator  37.22 
 
 
175 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.323793  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1656  hypothetical protein  33.94 
 
 
122 aa  104  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.0000870155  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5173  GcrA cell cycle regulator  39.43 
 
 
188 aa  97.8  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588722  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3377  GcrA cell cycle regulator  38.85 
 
 
193 aa  97.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1309  GcrA cell cycle regulator  32.16 
 
 
232 aa  89.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473507  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4617  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0717  GcrA cell cycle regulator  49.06 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2007  hypothetical protein  49.06 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2043  GcrA cell cycle regulator  49.06 
 
 
201 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5796  GcrA cell cycle regulator  32.26 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4580  GcrA cell cycle regulator  41.79 
 
 
219 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2480  GcrA cell cycle regulator  42.59 
 
 
235 aa  55.1  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1094  GcrA cell cycle regulator  40.74 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4846  hypothetical protein  40.74 
 
 
87 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0233565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5831  hypothetical protein  32.93 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.594527  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1905  GcrA cell cycle regulator  31.25 
 
 
144 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135839  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0757  hypothetical protein  47.5 
 
 
99 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.200451  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>