49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2043 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2043  GcrA cell cycle regulator  100 
 
 		 201 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482667 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3104  GcrA cell cycle regulator  74.15 
 
 		 205 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0886192  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2616  putative gcrA cell cycle regulator  70.67 
 
 		 207 aa  261  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.374735  hitchhiker  0.00797611 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2007  hypothetical protein  70.53 
 
 		 207 aa  257  7e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0662  GcrA cell cycle regulator  68.81 
 
 		 196 aa  256  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1020  GcrA cell cycle regulator  70.15 
 
 		 195 aa  244  8e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0717  GcrA cell cycle regulator  67.63 
 
 		 207 aa  244  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1217  GcrA cell cycle regulator  46.27 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0126  GcrA cell cycle regulator  42.29 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_004310  BR0299  hypothetical protein  42.08 
 
 		 180 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7422  GcrA cell cycle regulator  45.32 
 
 		 176 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0313  hypothetical protein  42.08 
 
 		 180 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0393  GcrA cell cycle regulator  41.09 
 
 		 179 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5260  GcrA cell cycle regulator  40.61 
 
 		 169 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980946  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0894  GcrA cell cycle regulator  40.61 
 
 		 170 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0782  GcrA cell cycle regulator  41.12 
 
 		 169 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0484  hypothetical protein  40.72 
 
 		 183 aa  137  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1289  GcrA cell cycle regulator  39 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6684  GcrA cell cycle regulator  44.78 
 
 		 175 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3667  GcrA cell cycle regulator  43.41 
 
 		 189 aa  135  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1228  GcrA cell cycle regulator  45.69 
 
 		 172 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0613007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0641  GcrA cell cycle regulator  39.2 
 
 		 168 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4917  GcrA cell cycle regulator  39.09 
 
 		 169 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0758  global cell cycle regulator GcrA  41.21 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  0.136317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3361  GcrA cell cycle regulator  39.3 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513155  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0512  GcrA cell cycle regulator  37.56 
 
 		 168 aa  128  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.711228  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4719  GcrA cell cycle regulator  40.5 
 
 		 179 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5186  GcrA cell cycle regulator  40.5 
 
 		 179 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0184  GcrA cell cycle regulator  39.29 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.624158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0010  global cell cycle regulator GcrA  41.5 
 
 		 202 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0174  GcrA cell cycle regulator  39.69 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0400  GcrA cell cycle regulator  40.53 
 
 		 171 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.800641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5258  GcrA cell cycle regulator  41.09 
 
 		 179 aa  121  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4580  GcrA cell cycle regulator  45.32 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1094  GcrA cell cycle regulator  39.53 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0833  GcrA cell cycle regulator  37.32 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00984482 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5173  GcrA cell cycle regulator  40.1 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3075  GcrA cell cycle regulator  30.77 
 
 		 162 aa  98.6  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1309  GcrA cell cycle regulator  35.06 
 
 		 232 aa  95.9  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2169  GcrA cell cycle regulator  33.17 
 
 		 175 aa  88.6  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.323793  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2480  GcrA cell cycle regulator  70.83 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4617  hypothetical protein  30.26 
 
 		 159 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4709  GcrA cell cycle regulator  52.38 
 
 		 130 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0264058  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4194  GcrA cell cycle regulator  54.17 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0485  global cell cycle regulator GcrA  49.06 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1656  hypothetical protein  45.21 
 
 		 122 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.0000870155  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3377  GcrA cell cycle regulator  44.9 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5831  hypothetical protein  26.9 
 
 		 178 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.594527  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  29.76 
 
 		 1888 aa  46.2  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>