35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5831 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5831  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  359  9e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.594527  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5796  GcrA cell cycle regulator  33.54 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6684  GcrA cell cycle regulator  32.34 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1228  GcrA cell cycle regulator  32.07 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0613007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3667  GcrA cell cycle regulator  29.61 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7422  GcrA cell cycle regulator  32.75 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424183  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0782  GcrA cell cycle regulator  27.78 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5260  GcrA cell cycle regulator  29.45 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980946  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0393  GcrA cell cycle regulator  28.42 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0894  GcrA cell cycle regulator  29.45 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1217  GcrA cell cycle regulator  28.57 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0758  global cell cycle regulator GcrA  30.99 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  0.136317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0400  GcrA cell cycle regulator  29.3 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.800641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0299  hypothetical protein  26.74 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4194  GcrA cell cycle regulator  29.01 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0126  GcrA cell cycle regulator  29.57 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0313  hypothetical protein  26.74 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0662  GcrA cell cycle regulator  23.83 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4917  GcrA cell cycle regulator  30.06 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3104  GcrA cell cycle regulator  26.87 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0886192  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3075  GcrA cell cycle regulator  29.14 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0641  GcrA cell cycle regulator  28.92 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5186  GcrA cell cycle regulator  28.16 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1656  hypothetical protein  26.32 
 
 		 122 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.0000870155  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4719  GcrA cell cycle regulator  28.16 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27224 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5173  GcrA cell cycle regulator  27.68 
 
 		 188 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1289  GcrA cell cycle regulator  26.11 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0485  global cell cycle regulator GcrA  31.33 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4709  GcrA cell cycle regulator  26.99 
 
 		 130 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0264058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0010  global cell cycle regulator GcrA  25.81 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2169  GcrA cell cycle regulator  29.76 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.323793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5258  GcrA cell cycle regulator  27.17 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0484  hypothetical protein  28.98 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1020  GcrA cell cycle regulator  26.18 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0184  GcrA cell cycle regulator  28.32 
 
 		 177 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.624158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>