50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0662 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0662  GcrA cell cycle regulator  100 
 
 		 196 aa  391  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3104  GcrA cell cycle regulator  67.8 
 
 		 205 aa  263  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0886192  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2616  putative gcrA cell cycle regulator  68.9 
 
 		 207 aa  261  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.374735  hitchhiker  0.00797611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1020  GcrA cell cycle regulator  70.5 
 
 		 195 aa  257  7e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2007  hypothetical protein  63.77 
 
 		 207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2043  GcrA cell cycle regulator  63.68 
 
 		 201 aa  239  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482667 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0717  GcrA cell cycle regulator  63.29 
 
 		 207 aa  235  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0393  GcrA cell cycle regulator  42.78 
 
 		 179 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0299  hypothetical protein  42.78 
 
 		 180 aa  147  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0313  hypothetical protein  42.78 
 
 		 180 aa  147  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0126  GcrA cell cycle regulator  44.04 
 
 		 187 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3667  GcrA cell cycle regulator  43.3 
 
 		 189 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0758  global cell cycle regulator GcrA  44.33 
 
 		 171 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  0.136317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1217  GcrA cell cycle regulator  45.69 
 
 		 174 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0484  hypothetical protein  43.98 
 
 		 183 aa  141  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1289  GcrA cell cycle regulator  40.72 
 
 		 179 aa  141  8e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6684  GcrA cell cycle regulator  44.1 
 
 		 175 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7422  GcrA cell cycle regulator  41.12 
 
 		 176 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424183  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0184  GcrA cell cycle regulator  42.93 
 
 		 177 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.624158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5186  GcrA cell cycle regulator  41.33 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4719  GcrA cell cycle regulator  41.33 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0512  GcrA cell cycle regulator  42.71 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.711228  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0782  GcrA cell cycle regulator  42.78 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0641  GcrA cell cycle regulator  41.67 
 
 		 168 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0894  GcrA cell cycle regulator  41.75 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5260  GcrA cell cycle regulator  41.75 
 
 		 169 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0010  global cell cycle regulator GcrA  43.01 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4917  GcrA cell cycle regulator  41.84 
 
 		 169 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1228  GcrA cell cycle regulator  43.37 
 
 		 172 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0613007 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0174  GcrA cell cycle regulator  42.93 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3361  GcrA cell cycle regulator  39.8 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513155  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5258  GcrA cell cycle regulator  38.46 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0400  GcrA cell cycle regulator  41.08 
 
 		 171 aa  124  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.800641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0485  global cell cycle regulator GcrA  41.24 
 
 		 177 aa  124  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0833  GcrA cell cycle regulator  39.05 
 
 		 220 aa  122  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00984482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1094  GcrA cell cycle regulator  40.95 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5173  GcrA cell cycle regulator  37.69 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3075  GcrA cell cycle regulator  31.58 
 
 		 162 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4709  GcrA cell cycle regulator  32.09 
 
 		 130 aa  92  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0264058  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2169  GcrA cell cycle regulator  31.47 
 
 		 175 aa  91.7  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.323793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4194  GcrA cell cycle regulator  31.55 
 
 		 128 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3377  GcrA cell cycle regulator  32.8 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1309  GcrA cell cycle regulator  31.93 
 
 		 232 aa  87  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4617  hypothetical protein  31.05 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4580  GcrA cell cycle regulator  70.83 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2480  GcrA cell cycle regulator  72.92 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1656  hypothetical protein  52.08 
 
 		 122 aa  61.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.0000870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5831  hypothetical protein  23.83 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.594527  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1196  hypothetical protein  31.58 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5796  GcrA cell cycle regulator  24.08 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>