53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0126 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0126  GcrA cell cycle regulator  100 
 
 		 187 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0184  GcrA cell cycle regulator  75.6 
 
 		 177 aa  255  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.624158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0174  GcrA cell cycle regulator  75 
 
 		 177 aa  241  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0393  GcrA cell cycle regulator  63.74 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0299  hypothetical protein  62.84 
 
 		 180 aa  217  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0313  hypothetical protein  62.84 
 
 		 180 aa  217  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0484  hypothetical protein  66.09 
 
 		 183 aa  211  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0010  global cell cycle regulator GcrA  60.11 
 
 		 202 aa  194  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1289  GcrA cell cycle regulator  52.81 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0641  GcrA cell cycle regulator  54.39 
 
 		 168 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4917  GcrA cell cycle regulator  55.11 
 
 		 169 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0894  GcrA cell cycle regulator  53.63 
 
 		 170 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5260  GcrA cell cycle regulator  55.75 
 
 		 169 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980946  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0512  GcrA cell cycle regulator  52.63 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.711228  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1217  GcrA cell cycle regulator  52.6 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0782  GcrA cell cycle regulator  52.3 
 
 		 169 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0758  global cell cycle regulator GcrA  52.05 
 
 		 171 aa  160  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  0.136317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3667  GcrA cell cycle regulator  46.15 
 
 		 189 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7422  GcrA cell cycle regulator  51.16 
 
 		 176 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424183  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5186  GcrA cell cycle regulator  45.35 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6684  GcrA cell cycle regulator  46.78 
 
 		 175 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4719  GcrA cell cycle regulator  45.35 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0400  GcrA cell cycle regulator  50 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.800641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0485  global cell cycle regulator GcrA  46.2 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3361  GcrA cell cycle regulator  44 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513155  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3104  GcrA cell cycle regulator  40.2 
 
 		 205 aa  137  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0886192  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0662  GcrA cell cycle regulator  41.24 
 
 		 196 aa  137  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5258  GcrA cell cycle regulator  41.62 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1228  GcrA cell cycle regulator  48.26 
 
 		 172 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0613007 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1020  GcrA cell cycle regulator  38.78 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0833  GcrA cell cycle regulator  36.06 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00984482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3377  GcrA cell cycle regulator  38.73 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1094  GcrA cell cycle regulator  33.17 
 
 		 230 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5173  GcrA cell cycle regulator  36.81 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3075  GcrA cell cycle regulator  34.91 
 
 		 162 aa  95.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2169  GcrA cell cycle regulator  37.64 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.323793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4194  GcrA cell cycle regulator  33.14 
 
 		 128 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4617  hypothetical protein  35.12 
 
 		 159 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4709  GcrA cell cycle regulator  33.73 
 
 		 130 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0264058  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1656  hypothetical protein  33.13 
 
 		 122 aa  84.7  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.0000870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2616  putative gcrA cell cycle regulator  70.91 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.374735  hitchhiker  0.00797611 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0717  GcrA cell cycle regulator  72.22 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2007  hypothetical protein  69.64 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2043  GcrA cell cycle regulator  56.9 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4580  GcrA cell cycle regulator  44 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1309  GcrA cell cycle regulator  50 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2480  GcrA cell cycle regulator  40 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5831  hypothetical protein  27.84 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.594527  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5796  GcrA cell cycle regulator  27.65 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0696  hypothetical protein  35.14 
 
 		 98 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4846  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0233565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0757  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.200451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6972  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>