50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1228 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1228  GcrA cell cycle regulator  100 
 
 		 172 aa  350  8e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0613007 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0485  global cell cycle regulator GcrA  58.13 
 
 		 177 aa  157  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0400  GcrA cell cycle regulator  55.69 
 
 		 171 aa  156  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.800641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1217  GcrA cell cycle regulator  51.46 
 
 		 174 aa  147  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7422  GcrA cell cycle regulator  50 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6684  GcrA cell cycle regulator  46.29 
 
 		 175 aa  137  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5260  GcrA cell cycle regulator  49.1 
 
 		 169 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980946  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4719  GcrA cell cycle regulator  45.18 
 
 		 179 aa  134  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5186  GcrA cell cycle regulator  45.18 
 
 		 179 aa  134  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0393  GcrA cell cycle regulator  45.51 
 
 		 179 aa  133  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0126  GcrA cell cycle regulator  48.26 
 
 		 187 aa  134  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0641  GcrA cell cycle regulator  47.9 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0512  GcrA cell cycle regulator  46.51 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.711228  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0758  global cell cycle regulator GcrA  48.78 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  0.136317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0782  GcrA cell cycle regulator  49.11 
 
 		 169 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3667  GcrA cell cycle regulator  46.41 
 
 		 189 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5258  GcrA cell cycle regulator  44.57 
 
 		 179 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0313  hypothetical protein  44.69 
 
 		 180 aa  130  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0299  hypothetical protein  44.69 
 
 		 180 aa  130  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0894  GcrA cell cycle regulator  47.9 
 
 		 170 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4917  GcrA cell cycle regulator  47.02 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0662  GcrA cell cycle regulator  42.35 
 
 		 196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3361  GcrA cell cycle regulator  41.99 
 
 		 177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513155  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0484  hypothetical protein  45.76 
 
 		 183 aa  127  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3075  GcrA cell cycle regulator  41.28 
 
 		 162 aa  124  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0010  global cell cycle regulator GcrA  45.2 
 
 		 202 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3104  GcrA cell cycle regulator  42.93 
 
 		 205 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0886192  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1020  GcrA cell cycle regulator  38.69 
 
 		 195 aa  121  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1289  GcrA cell cycle regulator  39.89 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0184  GcrA cell cycle regulator  43.53 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.624158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0174  GcrA cell cycle regulator  44.12 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0833  GcrA cell cycle regulator  38.57 
 
 		 220 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00984482 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2616  putative gcrA cell cycle regulator  39.32 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.374735  hitchhiker  0.00797611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1656  hypothetical protein  38.41 
 
 		 122 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.0000870155  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1094  GcrA cell cycle regulator  34.74 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2169  GcrA cell cycle regulator  36.9 
 
 		 175 aa  98.6  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.323793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4194  GcrA cell cycle regulator  34.59 
 
 		 128 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3377  GcrA cell cycle regulator  43.23 
 
 		 193 aa  94.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4709  GcrA cell cycle regulator  37.66 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0264058  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5173  GcrA cell cycle regulator  40.24 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2007  hypothetical protein  80 
 
 		 207 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0717  GcrA cell cycle regulator  80 
 
 		 207 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4617  hypothetical protein  34.84 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1309  GcrA cell cycle regulator  52.94 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2043  GcrA cell cycle regulator  50.98 
 
 		 201 aa  60.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4580  GcrA cell cycle regulator  34.02 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5831  hypothetical protein  29.79 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.594527  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5796  GcrA cell cycle regulator  34.36 
 
 		 172 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2480  GcrA cell cycle regulator  44.68 
 
 		 235 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1905  GcrA cell cycle regulator  33.99 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>