47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1309 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1309  GcrA cell cycle regulator  100 
 
 
232 aa  444  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473507  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2169  GcrA cell cycle regulator  42.92 
 
 
175 aa  153  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.323793  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1094  GcrA cell cycle regulator  34.67 
 
 
230 aa  99.4  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0894  GcrA cell cycle regulator  30 
 
 
170 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4719  GcrA cell cycle regulator  32.31 
 
 
179 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5186  GcrA cell cycle regulator  32.31 
 
 
179 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3667  GcrA cell cycle regulator  31.6 
 
 
189 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0662  GcrA cell cycle regulator  32.02 
 
 
196 aa  90.1  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3104  GcrA cell cycle regulator  32.89 
 
 
205 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0886192  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0641  GcrA cell cycle regulator  29 
 
 
168 aa  88.6  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1289  GcrA cell cycle regulator  28.33 
 
 
179 aa  88.6  8e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5258  GcrA cell cycle regulator  31.44 
 
 
179 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0299  hypothetical protein  30.04 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0393  GcrA cell cycle regulator  28.32 
 
 
179 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0126  GcrA cell cycle regulator  31.36 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0313  hypothetical protein  30.04 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1656  hypothetical protein  59.32 
 
 
122 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.0000870155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7422  GcrA cell cycle regulator  29.57 
 
 
176 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424183  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4917  GcrA cell cycle regulator  28.33 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0833  GcrA cell cycle regulator  33.48 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00984482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6684  GcrA cell cycle regulator  30 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1217  GcrA cell cycle regulator  60 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5260  GcrA cell cycle regulator  58.14 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0782  GcrA cell cycle regulator  58.14 
 
 
169 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0485  global cell cycle regulator GcrA  49.21 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193907  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0758  global cell cycle regulator GcrA  55.81 
 
 
171 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  0.136317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0400  GcrA cell cycle regulator  66.67 
 
 
171 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.800641  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1228  GcrA cell cycle regulator  52.94 
 
 
172 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0613007 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0512  GcrA cell cycle regulator  52.83 
 
 
168 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.711228  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3361  GcrA cell cycle regulator  54.35 
 
 
177 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513155  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3075  GcrA cell cycle regulator  47.17 
 
 
162 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0484  hypothetical protein  48.21 
 
 
183 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2043  GcrA cell cycle regulator  52.27 
 
 
201 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482667 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1020  GcrA cell cycle regulator  47.92 
 
 
195 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0010  global cell cycle regulator GcrA  50 
 
 
202 aa  56.6  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4580  GcrA cell cycle regulator  61.11 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0174  GcrA cell cycle regulator  51.11 
 
 
177 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0184  GcrA cell cycle regulator  51.11 
 
 
177 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.624158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2616  putative gcrA cell cycle regulator  42.03 
 
 
207 aa  55.5  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.374735  hitchhiker  0.00797611 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0717  GcrA cell cycle regulator  42.03 
 
 
207 aa  55.1  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2007  hypothetical protein  42.03 
 
 
207 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3377  GcrA cell cycle regulator  57.14 
 
 
193 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2480  GcrA cell cycle regulator  58.33 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5173  GcrA cell cycle regulator  54.17 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588722  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4194  GcrA cell cycle regulator  51.16 
 
 
128 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16142  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4709  GcrA cell cycle regulator  50 
 
 
130 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0264058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4617  hypothetical protein  48.57 
 
 
159 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.135272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>