51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0184 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0184  GcrA cell cycle regulator  100 
 
 
177 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.624158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0174  GcrA cell cycle regulator  95.83 
 
 
177 aa  297  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0126  GcrA cell cycle regulator  76.02 
 
 
187 aa  271  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0484  hypothetical protein  66.67 
 
 
183 aa  233  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0393  GcrA cell cycle regulator  60.77 
 
 
179 aa  206  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0299  hypothetical protein  60.77 
 
 
180 aa  201  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0313  hypothetical protein  60.77 
 
 
180 aa  201  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0010  global cell cycle regulator GcrA  58.19 
 
 
202 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1289  GcrA cell cycle regulator  52.22 
 
 
179 aa  174  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5260  GcrA cell cycle regulator  51.98 
 
 
169 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980946  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0894  GcrA cell cycle regulator  52.63 
 
 
170 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4917  GcrA cell cycle regulator  50.86 
 
 
169 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0641  GcrA cell cycle regulator  49.71 
 
 
168 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0782  GcrA cell cycle regulator  50.28 
 
 
169 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0758  global cell cycle regulator GcrA  50.28 
 
 
171 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  0.136317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3667  GcrA cell cycle regulator  46.7 
 
 
189 aa  155  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0512  GcrA cell cycle regulator  50.29 
 
 
168 aa  154  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.711228  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1217  GcrA cell cycle regulator  46.78 
 
 
174 aa  148  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7422  GcrA cell cycle regulator  45.66 
 
 
176 aa  140  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6684  GcrA cell cycle regulator  45.35 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3104  GcrA cell cycle regulator  40.59 
 
 
205 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0886192  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0662  GcrA cell cycle regulator  43.23 
 
 
196 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5186  GcrA cell cycle regulator  41.76 
 
 
179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4719  GcrA cell cycle regulator  41.76 
 
 
179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0400  GcrA cell cycle regulator  50.3 
 
 
171 aa  131  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.800641  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0485  global cell cycle regulator GcrA  43.86 
 
 
177 aa  131  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193907  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3361  GcrA cell cycle regulator  41.52 
 
 
177 aa  131  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513155  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5258  GcrA cell cycle regulator  39.58 
 
 
179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1020  GcrA cell cycle regulator  36.13 
 
 
195 aa  125  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1228  GcrA cell cycle regulator  44.51 
 
 
172 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0613007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2616  putative gcrA cell cycle regulator  36.76 
 
 
207 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.374735  hitchhiker  0.00797611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0833  GcrA cell cycle regulator  37.56 
 
 
220 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00984482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3377  GcrA cell cycle regulator  36.31 
 
 
193 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3075  GcrA cell cycle regulator  37.2 
 
 
162 aa  101  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5173  GcrA cell cycle regulator  35.54 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588722  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4194  GcrA cell cycle regulator  34.1 
 
 
128 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16142  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2169  GcrA cell cycle regulator  31.05 
 
 
175 aa  88.2  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.323793  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4709  GcrA cell cycle regulator  33.91 
 
 
130 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0264058  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1656  hypothetical protein  31.74 
 
 
122 aa  87.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.0000870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4617  hypothetical protein  35.71 
 
 
159 aa  85.9  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2043  GcrA cell cycle regulator  71.7 
 
 
201 aa  80.9  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482667 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2007  hypothetical protein  70.37 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0717  GcrA cell cycle regulator  60 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4580  GcrA cell cycle regulator  66.67 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2480  GcrA cell cycle regulator  68.75 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1309  GcrA cell cycle regulator  39.53 
 
 
232 aa  58.9  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473507  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1094  GcrA cell cycle regulator  44 
 
 
230 aa  53.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5831  hypothetical protein  27.06 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.594527  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0757  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.200451  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5796  GcrA cell cycle regulator  23.53 
 
 
172 aa  42  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0696  hypothetical protein  30.86 
 
 
98 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>