27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0757 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0757  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  208  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.200451  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0696  hypothetical protein  71.13 
 
 
98 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2440  hypothetical protein  56.7 
 
 
98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4846  hypothetical protein  51.92 
 
 
87 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0233565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4917  GcrA cell cycle regulator  37.23 
 
 
169 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0641  GcrA cell cycle regulator  35.56 
 
 
168 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0758  global cell cycle regulator GcrA  38.67 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  0.136317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1905  GcrA cell cycle regulator  43.64 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135839  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0512  GcrA cell cycle regulator  44.44 
 
 
168 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.711228  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5260  GcrA cell cycle regulator  35.63 
 
 
169 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980946  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0894  GcrA cell cycle regulator  36.17 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0484  hypothetical protein  38.57 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0126  GcrA cell cycle regulator  50 
 
 
187 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0782  GcrA cell cycle regulator  36.17 
 
 
169 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1309  GcrA cell cycle regulator  43.59 
 
 
232 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473507  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0184  GcrA cell cycle regulator  50 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.624158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0174  GcrA cell cycle regulator  50 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2169  GcrA cell cycle regulator  43.59 
 
 
175 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.323793  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0485  global cell cycle regulator GcrA  47.5 
 
 
177 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193907  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0010  global cell cycle regulator GcrA  47.5 
 
 
202 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4580  GcrA cell cycle regulator  45 
 
 
219 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0393  GcrA cell cycle regulator  38.6 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1656  hypothetical protein  42.5 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.0000870155  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0299  hypothetical protein  38.6 
 
 
180 aa  40.8  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0313  hypothetical protein  38.6 
 
 
180 aa  40.8  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1228  GcrA cell cycle regulator  45 
 
 
172 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0613007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0400  GcrA cell cycle regulator  43.9 
 
 
171 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.800641  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>