50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1217 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1217  GcrA cell cycle regulator  100 
 
 		 174 aa  356  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5260  GcrA cell cycle regulator  62.28 
 
 		 169 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0782  GcrA cell cycle regulator  61.31 
 
 		 169 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0758  global cell cycle regulator GcrA  60.48 
 
 		 171 aa  195  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  0.136317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0894  GcrA cell cycle regulator  60.36 
 
 		 170 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0641  GcrA cell cycle regulator  59.28 
 
 		 168 aa  193  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4917  GcrA cell cycle regulator  58.58 
 
 		 169 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0512  GcrA cell cycle regulator  57.74 
 
 		 168 aa  191  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.711228  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3667  GcrA cell cycle regulator  55.43 
 
 		 189 aa  187  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_004310  BR0299  hypothetical protein  49.73 
 
 		 180 aa  173  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0313  hypothetical protein  49.73 
 
 		 180 aa  173  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0393  GcrA cell cycle regulator  49.45 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0126  GcrA cell cycle regulator  52.6 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1289  GcrA cell cycle regulator  47.8 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5186  GcrA cell cycle regulator  49.72 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4719  GcrA cell cycle regulator  49.72 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7422  GcrA cell cycle regulator  50.27 
 
 		 176 aa  158  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6684  GcrA cell cycle regulator  51.41 
 
 		 175 aa  157  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5258  GcrA cell cycle regulator  48.07 
 
 		 179 aa  154  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1228  GcrA cell cycle regulator  52.91 
 
 		 172 aa  154  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0613007 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0484  hypothetical protein  48 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0485  global cell cycle regulator GcrA  50.3 
 
 		 177 aa  151  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0010  global cell cycle regulator GcrA  48.07 
 
 		 202 aa  148  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0400  GcrA cell cycle regulator  54.94 
 
 		 171 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.800641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3361  GcrA cell cycle regulator  46.24 
 
 		 177 aa  147  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513155  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3104  GcrA cell cycle regulator  43.41 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0886192  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0662  GcrA cell cycle regulator  43.15 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0184  GcrA cell cycle regulator  47.34 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.624158 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0833  GcrA cell cycle regulator  43.33 
 
 		 220 aa  138  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00984482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0174  GcrA cell cycle regulator  47.34 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1020  GcrA cell cycle regulator  44.62 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2616  putative gcrA cell cycle regulator  42.38 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.374735  hitchhiker  0.00797611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3075  GcrA cell cycle regulator  38.89 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3377  GcrA cell cycle regulator  39.02 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4194  GcrA cell cycle regulator  37.87 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2169  GcrA cell cycle regulator  40.56 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.323793  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1656  hypothetical protein  35.22 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.0000870155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4709  GcrA cell cycle regulator  37.65 
 
 		 130 aa  101  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0264058  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1309  GcrA cell cycle regulator  35.22 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5173  GcrA cell cycle regulator  38.64 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4617  hypothetical protein  35.98 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2043  GcrA cell cycle regulator  77.19 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482667 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2007  hypothetical protein  52.54 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0717  GcrA cell cycle regulator  52.54 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4580  GcrA cell cycle regulator  50 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2480  GcrA cell cycle regulator  50 
 
 		 235 aa  67.8  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1094  GcrA cell cycle regulator  48 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5796  GcrA cell cycle regulator  29.09 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5831  hypothetical protein  28.4 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.594527  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4846  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  41.6  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0233565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>