259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6953 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6953  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
259 aa  497  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2588  HpcH/HpaI aldolase  43.1 
 
 
258 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0901158  hitchhiker  0.00712215 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2673  HpcH/HpaI aldolase  43.75 
 
 
258 aa  182  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00880  aldolase protein  48.99 
 
 
267 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0143693  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0113  HpcH/HpaI aldolase  36.59 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0109  HpcH/HpaI aldolase  36.59 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0585  HpcH/HpaI aldolase  39.52 
 
 
259 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170473  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4781  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  41.08 
 
 
259 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131567  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1111  HpcH/HpaI aldolase  43.78 
 
 
251 aa  148  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0589091  normal  0.717046 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1540  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  42.64 
 
 
264 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0716  putative aldolase  39.92 
 
 
253 aa  135  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0565774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2821  HpcH/HpaI aldolase  35.44 
 
 
254 aa  126  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1881  HpcH/HpaI aldolase  35.32 
 
 
254 aa  125  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1595  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  34.83 
 
 
255 aa  125  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3771  HpcH/HpaI aldolase  34.44 
 
 
261 aa  122  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635627  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0323  HpcH/HpaI aldolase  33.2 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187244  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1241  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  34.69 
 
 
259 aa  119  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.431115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4475  HpcH/HpaI aldolase  36.89 
 
 
273 aa  118  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000552793 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4400  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  36.7 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.125493  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3924  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  37.18 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.782529  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1457  HpcH/HpaI aldolase  38.38 
 
 
279 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1896  HpcH/HpaI aldolase  34.78 
 
 
268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3089  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  34.44 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0555789  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2482  HpcH/HpaI aldolase  32.37 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1071  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  36.74 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0826  HpcH/HpaI aldolase  38.33 
 
 
267 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.146746  unclonable  0.000000000657155 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2181  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.84 
 
 
272 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5698  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  38.98 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3740  HpcH/HpaI aldolase  33.75 
 
 
250 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3658  putative 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.93 
 
 
266 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1422  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.38 
 
 
256 aa  108  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0413862 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7095  HpcH/HpaI aldolase  38.54 
 
 
256 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859746  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3135  HpcH/HpaI aldolase  34.91 
 
 
254 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1776  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  35 
 
 
254 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170992  normal  0.538418 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3855  HpcH/HpaI aldolase  33.77 
 
 
253 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1633  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  34.76 
 
 
261 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3014  putative aldolase protein  33.33 
 
 
250 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2073  HpcH/HpaI aldolase  31.07 
 
 
258 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3396  HpcH/HpaI aldolase  32.93 
 
 
266 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05295  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
277 aa  106  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0871  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  34.75 
 
 
266 aa  105  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1624  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  36.21 
 
 
253 aa  103  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1499  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  34.33 
 
 
266 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4135  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  35.21 
 
 
253 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.960195  normal  0.819537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1647  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  34.43 
 
 
260 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000936212 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0507  putative HpcH/HpaI aldolase  31.49 
 
 
253 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208943  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0429  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.82 
 
 
253 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10570  putative 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  35.1 
 
 
268 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  35.1 
 
 
266 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2034  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase(HpaI)  31.5 
 
 
267 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0580276  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5927  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  36.27 
 
 
264 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3561  aldolase  36.13 
 
 
265 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0519  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.7 
 
 
255 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000218683  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1411  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.65 
 
 
255 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0315815  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2586  HpcH/HpaI aldolase  38.24 
 
 
251 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000566664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1057  HpcH/HpaI aldolase  31.48 
 
 
257 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4270  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  35.34 
 
 
271 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.755351  normal  0.6903 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6205  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  38.22 
 
 
256 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.424474  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3725  HpcH/HpaI aldolase  36.96 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1797  HpcH/HpaI aldolase  31.12 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  0.716288 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3485  HpcH/HpaI aldolase  37.08 
 
 
249 aa  98.6  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.547567  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4065  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.03 
 
 
256 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.62895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6019  HpcH/HpaI aldolase  35.78 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0115  HpcH/HpaI aldolase  31.15 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1078  HpcH/HpaI aldolase  31.9 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.511599  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6846  HpcH/HpaI aldolase  34.57 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2830  HpcH/HpaI aldolase  33.16 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3886  HpcH/HpaI aldolase  34.44 
 
 
262 aa  95.9  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.21023  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3503  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.65 
 
 
267 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037052  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4446  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.06 
 
 
268 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0830561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3079  HpcH/HpaI aldolase  35.33 
 
 
261 aa  95.1  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500302  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00240  aldolase, putative  29.2 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3136  HpcH/HpaI aldolase  35.96 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4579  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.19 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3223  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  35.6 
 
 
266 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3568  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.52 
 
 
256 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.809818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6527  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32 
 
 
261 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.098717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2327  HpcH/HpaI aldolase  31.51 
 
 
263 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02555  hypothetical protein  30.91 
 
 
249 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14021  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  25.71 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.590779  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4885  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.75 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0810  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  31.42 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3707  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.75 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3554  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.04 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04225  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.84 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04191  hypothetical protein  32.84 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02750  conserved hypothetical protein  30.48 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.617702  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1950  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.97 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46590  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.61 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3394  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.04 
 
 
256 aa  92.8  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2345  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.75 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3421  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  28.33 
 
 
256 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3604  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  28.33 
 
 
256 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01933  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  32.61 
 
 
253 aa  92.4  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0844  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.13 
 
 
256 aa  92.4  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1700  HpcH/HpaI aldolase  31.32 
 
 
258 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1613  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase protein  33.17 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137402  normal  0.0298275 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1156  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase, putative  30.49 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3577  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  34.34 
 
 
267 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3060  HpcH/HpaI aldolase  30.3 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388501  normal  0.0341829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>