258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1896 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1896  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
268 aa  558  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1540  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  41.05 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2821  HpcH/HpaI aldolase  30.52 
 
 
254 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00240  aldolase, putative  30.12 
 
 
267 aa  120  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10570  putative 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.48 
 
 
268 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6953  HpcH/HpaI aldolase  34.78 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.63 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4781  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.5 
 
 
259 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131567  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1647  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.38 
 
 
260 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000936212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1071  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  31.17 
 
 
257 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0239  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.57 
 
 
273 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2421  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.63 
 
 
254 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0070  HpcH/HpaI aldolase  29.66 
 
 
262 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2345  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.28 
 
 
268 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3577  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.41 
 
 
267 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3503  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.68 
 
 
267 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037052  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0113  HpcH/HpaI aldolase  32.23 
 
 
259 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4314  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.87 
 
 
251 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0109  HpcH/HpaI aldolase  32.23 
 
 
259 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7095  HpcH/HpaI aldolase  30.38 
 
 
256 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0810  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.15 
 
 
256 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02171  predicted 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.39 
 
 
267 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1413  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  28.39 
 
 
267 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02130  hypothetical protein  28.39 
 
 
267 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46590  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.03 
 
 
265 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3568  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  28.46 
 
 
256 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.809818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2387  putative aldolase  28.39 
 
 
267 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1404  putative aldolase  28.39 
 
 
267 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.174017  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1422  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  28.99 
 
 
256 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0413862 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4400  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  33.96 
 
 
265 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.125493  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8637  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.8 
 
 
255 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16514  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3725  HpcH/HpaI aldolase  30.13 
 
 
279 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1411  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.62 
 
 
255 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0315815  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1241  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.02 
 
 
259 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.431115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2399  putative aldolase  27.54 
 
 
267 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0475  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  29.72 
 
 
266 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3301  putative aldolase  27.38 
 
 
278 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05544  conserved hypothetical protein  30.8 
 
 
266 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0532227  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02991  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  26.67 
 
 
256 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0579  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  26.67 
 
 
256 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3315  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  26.67 
 
 
256 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02942  hypothetical protein  26.67 
 
 
256 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3924  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  32.47 
 
 
265 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.782529  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00850  conserved hypothetical protein  31.3 
 
 
269 aa  100  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4446  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.29 
 
 
268 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0830561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1950  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.21 
 
 
267 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2181  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.08 
 
 
272 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0844  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  28.34 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0574  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  26.27 
 
 
256 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2517  putative aldolase  26.92 
 
 
267 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343129  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2425  putative aldolase  26.92 
 
 
267 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4207  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.58 
 
 
256 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102546  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2529  putative aldolase  26.56 
 
 
267 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.388708  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3232  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  27.16 
 
 
257 aa  99.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2474  putative aldolase  26.56 
 
 
267 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2633  putative aldolase  26.92 
 
 
267 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.952271  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3719  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  29.32 
 
 
263 aa  99  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3103  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  31.28 
 
 
260 aa  99  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1457  HpcH/HpaI aldolase  29.32 
 
 
279 aa  98.6  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5698  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  31.36 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3421  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  26.27 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3604  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  26.27 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1057  HpcH/HpaI aldolase  29.96 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5927  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  27.41 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1776  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.3 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170992  normal  0.538418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3179  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.94 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0871  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  30.35 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6846  HpcH/HpaI aldolase  28.03 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4276  HpcH/HpaI aldolase  27.82 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0970  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.66 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal  0.0128827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1633  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.46 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4438  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  25.88 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.867031  normal  0.323849 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1624  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.34 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6019  HpcH/HpaI aldolase  31.93 
 
 
268 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0796  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  28.63 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2073  HpcH/HpaI aldolase  26.25 
 
 
258 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1613  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase protein  27.34 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137402  normal  0.0298275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3223  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  29.69 
 
 
266 aa  96.3  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1954  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.13 
 
 
268 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.505827  normal  0.0223643 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0115  HpcH/HpaI aldolase  31.3 
 
 
263 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3771  HpcH/HpaI aldolase  30.58 
 
 
261 aa  95.5  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635627  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6205  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.62 
 
 
256 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.424474  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1599  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  28.45 
 
 
260 aa  95.5  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0323  HpcH/HpaI aldolase  29.89 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187244  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3554  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  26.27 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04225  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.64 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6467  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.35 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3511  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  26.29 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4034  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  32.91 
 
 
260 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0140  HpcH/HpaI aldolase family protein  34.29 
 
 
261 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108512  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3608  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  26.29 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal  0.699221 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3442  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  26.29 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3547  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  26.29 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3439  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  26.29 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04191  hypothetical protein  30.64 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3394  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  25.88 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3804  HpcH/HpaI aldolase  28.03 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568502 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2691  HpcH/HpaI aldolase  35.16 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.553747  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1626  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.81 
 
 
268 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.948231  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2034  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase(HpaI)  27.31 
 
 
267 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0580276  normal  0.0815679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>