257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1078 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1078  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
264 aa  532  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.511599  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6846  HpcH/HpaI aldolase  41.06 
 
 
265 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3725  HpcH/HpaI aldolase  32.24 
 
 
279 aa  151  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1057  HpcH/HpaI aldolase  33.73 
 
 
257 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05295  conserved hypothetical protein  34.14 
 
 
277 aa  142  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6019  HpcH/HpaI aldolase  39.07 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4475  HpcH/HpaI aldolase  30.59 
 
 
273 aa  112  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000552793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1789  HpcH/HpaI aldolase  34.12 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17043  normal  0.157768 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1595  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.7 
 
 
255 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3155  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.91 
 
 
264 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1700  HpcH/HpaI aldolase  37.84 
 
 
258 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0519  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.49 
 
 
255 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000218683  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4276  HpcH/HpaI aldolase  35.71 
 
 
258 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0400534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2073  HpcH/HpaI aldolase  30.24 
 
 
258 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2944  putative aldolase  34.27 
 
 
259 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0711573  normal  0.972329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1241  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.52 
 
 
259 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.431115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2588  HpcH/HpaI aldolase  31.75 
 
 
258 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0901158  hitchhiker  0.00712215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1711  HpcH/HpaI aldolase  32.71 
 
 
258 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4781  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.56 
 
 
259 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131567  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0585  HpcH/HpaI aldolase  37.75 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170473  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6953  HpcH/HpaI aldolase  31.9 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2482  HpcH/HpaI aldolase  32.71 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1624  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.76 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3145  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  34.58 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.462882  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2673  HpcH/HpaI aldolase  32.98 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1540  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.72 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7363  HpcH/HpaI aldolase  31.03 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.431693 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0871  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  28.4 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1422  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  28.14 
 
 
256 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0413862 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1122  HpcH/HpaI aldolase  36.49 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.597094 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1797  HpcH/HpaI aldolase  36.16 
 
 
250 aa  95.1  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  0.716288 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4400  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  29.78 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.125493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0826  HpcH/HpaI aldolase  29.59 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.146746  unclonable  0.000000000657155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0974  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.97 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2399  putative aldolase  31.31 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02750  conserved hypothetical protein  28.02 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.617702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3136  HpcH/HpaI aldolase  32.38 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02171  predicted 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.1 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1413  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.1 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02130  hypothetical protein  31.1 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2387  putative aldolase  31.1 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3586  HpcH/HpaI aldolase  31.71 
 
 
276 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1404  putative aldolase  31.1 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.174017  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1216  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.68 
 
 
263 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0790089  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3463  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.07 
 
 
254 aa  92  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1065  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.68 
 
 
263 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3503  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.46 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037052  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2285  HpcH/HpaI aldolase  37.84 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1181  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.77 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1201  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.77 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  normal  0.771297 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1170  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.3 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1071  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  28.81 
 
 
257 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2821  HpcH/HpaI aldolase  26.8 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0323  HpcH/HpaI aldolase  32.55 
 
 
263 aa  89  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187244  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6690  HpcH/HpaI aldolase  35.36 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0452123  normal  0.345013 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3886  HpcH/HpaI aldolase  31.17 
 
 
262 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.21023  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09230  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.44 
 
 
301 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380791  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5787  HpcH/HpaI aldolase  35.91 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0389238 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0113  HpcH/HpaI aldolase  29.05 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3054  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.92 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5035  HpcH/HpaI aldolase  31.49 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.577995  normal  0.525412 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0109  HpcH/HpaI aldolase  29.05 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2830  HpcH/HpaI aldolase  31.94 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4270  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  34.22 
 
 
271 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.755351  normal  0.6903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4314  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.68 
 
 
251 aa  86.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3171  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.53 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.537905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7095  HpcH/HpaI aldolase  31.84 
 
 
256 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859746  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2181  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.95 
 
 
272 aa  86.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2327  HpcH/HpaI aldolase  34.55 
 
 
263 aa  85.9  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5385  putative 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.13 
 
 
257 aa  85.5  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.539985  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1411  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.8 
 
 
255 aa  85.5  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0315815  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14021  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.62 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.590779  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3179  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.08 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02070  conserved hypothetical protein  26.83 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.413309  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1881  HpcH/HpaI aldolase  26.72 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4065  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.41 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.62895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3911  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.41 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0068475  normal  0.0363616 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3561  aldolase  28.7 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05330  conserved hypothetical protein  32.97 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0046  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.83 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04225  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.26 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04191  hypothetical protein  28.26 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0070  HpcH/HpaI aldolase  30.39 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2529  putative aldolase  30.37 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.388708  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2474  putative aldolase  30.37 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2517  putative aldolase  30.37 
 
 
267 aa  82  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343129  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2425  putative aldolase  30.37 
 
 
267 aa  82  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4034  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  29.65 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2633  putative aldolase  30.37 
 
 
267 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.952271  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0716  putative aldolase  32.82 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0565774 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3924  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  30 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.782529  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05544  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0532227  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3658  putative 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  25.81 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4324  HpcH/HpaI aldolase  30 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0970  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.33 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal  0.0128827 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4579  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.02 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2470  HpcH/HpaI aldolase  29.25 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6467  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  27.72 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0429  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.79 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3707  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.54 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>