More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4589 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4589  Amidase  100 
 
 
414 aa  803    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4799  amidase  85.27 
 
 
414 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2263  amidase  66.1 
 
 
410 aa  481  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241532  normal  0.548827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0916  amidase  69.08 
 
 
413 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0877  Amidase  68.84 
 
 
411 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0852  Amidase  70.29 
 
 
434 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766519  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1323  amidase  56.14 
 
 
421 aa  339  5e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1306  putative amidase  49.31 
 
 
438 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.902626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3290  amidase  48.8 
 
 
431 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3603  malonamidase E2  52.99 
 
 
433 aa  276  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5904  amidase  50.42 
 
 
427 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424342  normal  0.115898 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3419  amidase  43.99 
 
 
441 aa  250  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1032  amidase  39.9 
 
 
436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.516301  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2779  Amidase  44.77 
 
 
425 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2453  amidase  42.3 
 
 
467 aa  227  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.205936  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3331  amidase  42.25 
 
 
428 aa  219  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6302  amidase  39.46 
 
 
457 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7127  hypothetical protein  40.48 
 
 
436 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1179  amidase  35.71 
 
 
433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0309  putative amidase (amiD)  43.65 
 
 
448 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.613123  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3870  2-alkenal reductase  41.08 
 
 
454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.80719  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3015  amidase  41.48 
 
 
452 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3369  Asp-tRNA Asn/Glu-tRNA Gln amidotransferase subunit A  41.48 
 
 
452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0343  amidase  42.25 
 
 
450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1832  amidase  34.96 
 
 
429 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119712  normal  0.725364 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11219  amidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14410)  35.79 
 
 
442 aa  179  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.016892  normal  0.194738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1839  Amidase  39 
 
 
436 aa  162  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.47 
 
 
491 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4393  amidase  34.96 
 
 
450 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281674  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.25 
 
 
480 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.9 
 
 
479 aa  155  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0798  Amidase  37.33 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  30 
 
 
477 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  29.78 
 
 
472 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  32.98 
 
 
476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.51 
 
 
485 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.45 
 
 
475 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.67 
 
 
498 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.64 
 
 
483 aa  143  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3153  amidase  37.47 
 
 
412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0389149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1020  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.79 
 
 
487 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00154188  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.86 
 
 
491 aa  139  8.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02330  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.56 
 
 
477 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.313614  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.23 
 
 
487 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.53 
 
 
475 aa  137  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.38 
 
 
482 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0184  amidase  36.43 
 
 
480 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.71 
 
 
499 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  32.25 
 
 
458 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1115  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.87 
 
 
485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00160205  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1917  hypothetical protein  27.07 
 
 
494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1302  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.33 
 
 
491 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.584243  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1547  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.11 
 
 
472 aa  133  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460524  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  36.41 
 
 
454 aa  133  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1541  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  30.16 
 
 
486 aa  133  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.859243  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  34.97 
 
 
463 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.05 
 
 
486 aa  132  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2896  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.21 
 
 
488 aa  132  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.25 
 
 
483 aa  132  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3751  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.36 
 
 
485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1453  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.95 
 
 
477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.67645  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0231  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.27 
 
 
500 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.747986  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  33.33 
 
 
498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.21 
 
 
485 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  28.47 
 
 
486 aa  131  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0857  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.88 
 
 
434 aa  131  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0237  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.27 
 
 
500 aa  131  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.780008 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.57 
 
 
486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.47 
 
 
486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.45 
 
 
486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13411  amidase amiD (acylamidase)  31.31 
 
 
475 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1499  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.65 
 
 
472 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000099116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2838  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.15 
 
 
501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.62 
 
 
489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3559  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.39 
 
 
498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.55 
 
 
495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.94 
 
 
486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4434  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  30.6 
 
 
486 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.689377  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  34.37 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3176  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  33.33 
 
 
500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0151  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.45 
 
 
486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00414509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.75 
 
 
485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0075  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.93 
 
 
485 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.281052 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  33.88 
 
 
467 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  34.6 
 
 
473 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0208  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.75 
 
 
453 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.382536  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  31.91 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0163  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.5 
 
 
499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0085  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.35 
 
 
496 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1194  Amidase  34.38 
 
 
393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0374201  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2360  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.03 
 
 
487 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.100992  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4296  amidase  35.68 
 
 
474 aa  127  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.581919 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2615  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.51 
 
 
482 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.94 
 
 
486 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  33.11 
 
 
475 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  30.24 
 
 
464 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  35.29 
 
 
467 aa  126  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30 
 
 
485 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0682  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  29.3 
 
 
485 aa  126  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  29.64 
 
 
549 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>