33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3797 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3797  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  296  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0719  hypothetical protein  39.64 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3781  hypothetical protein  31.75 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4096  hypothetical protein  34.59 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7025  hypothetical protein  35.4 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.016448  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4184  pilus subunit transmembrane protein  37.14 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3348  hypothetical protein  30.33 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0415  hypothetical protein  33.61 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0224  pilus subunit transmembrane protein  35.4 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3516  hypothetical protein  29.23 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4197  hypothetical protein  32.73 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0395  hypothetical protein  33.66 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0610661  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1788  hypothetical protein  30.89 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3708  hypothetical protein  32.46 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0305  hypothetical protein  34.78 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2699  hypothetical protein  27.08 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2476  hypothetical protein  27.08 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  38.03 
 
 		 477 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  31.91 
 
 		 487 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2388  hypothetical protein  32.56 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00562819  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2404  hypothetical protein  26.04 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.817399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  31.91 
 
 		 484 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2823  hypothetical protein  32.56 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144299  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  34.15 
 
 		 460 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4472  pilus subunit transmembrane protein  36.52 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0228  hypothetical protein  30.77 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 461 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  35.82 
 
 		 460 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4193  type II and III secretion system protein  36.49 
 
 		 545 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  32.93 
 
 		 490 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  38.57 
 
 		 492 aa  41.2  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  33.87 
 
 		 408 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2580  hypothetical protein  38.46 
 
 		 217 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.948349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>