More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1761 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1761  formyl transferase domain protein  100 
 
 		 288 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5456  formyl transferase domain-containing protein  90.28 
 
 		 288 aa  535  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0931925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1060  formyl transferase domain-containing protein  76.04 
 
 		 288 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1190  formyl transferase domain protein  76.04 
 
 		 288 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.738205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0982  formyl transferase domain protein  79.86 
 
 		 288 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5625  formyl transferase domain-containing protein  74.65 
 
 		 287 aa  425  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.165091 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5673  formyl transferase domain-containing protein  50.18 
 
 		 284 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384109 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5891  formyl transferase domain-containing protein  49.82 
 
 		 284 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487641  normal  0.0186917 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  24.47 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00312  methionyl-tRNA formyltransferase  27.45 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1644  methionyl-tRNA formyltransferase  34.92 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  30.24 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0838  amino acid adenylation domain-containing protein  32.16 
 
 		 1541 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  26.82 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  25.61 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0633  formyl transferase domain protein  29.5 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353643  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  25.41 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  27.05 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  28.77 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  29.41 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  30.51 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  33.86 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  31.69 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  26.06 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2249  formyl transferase domain protein  28.9 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319035 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  31.15 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  31.15 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4569  formyl transferase domain-containing protein  30.33 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  31.15 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2353  methionyl-tRNA formyltransferase  31.15 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2805  methionyl-tRNA formyltransferase  31.15 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0143  methionyl-tRNA formyltransferase  31.15 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2275  methionyl-tRNA formyltransferase  31.15 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  26.86 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  26.74 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  28.06 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0129  methionyl-tRNA formyltransferase  30.29 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2402  amino acid adenylation  41.05 
 
 		 1519 aa  60.1  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4501  formyl transferase domain-containing protein  30.29 
 
 		 564 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4638  methionyl-tRNA formyltransferase  29.38 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  24.48 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3690  formyl transferase domain protein  36.8 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  26.41 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  27.61 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3877  methionyl-tRNA formyltransferase  26.79 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0907  methionyl-tRNA formyltransferase  27.78 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000822843  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  24.63 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000190251  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  25.34 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  29.27 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  24.02 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1236  formyltransferase, putative  21.54 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000369668  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  27.89 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  26.25 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  28.36 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  27.34 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1117  methionyl-tRNA formyltransferase  27.98 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  30.05 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0284  methionyl-tRNA formyltransferase  28.96 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0176978 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  28.36 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  26.25 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  24.91 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  28.89 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  28.12 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  24.34 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  30.05 
 
 		 327 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  28.28 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  28.38 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  30.65 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  30.87 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  26.32 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  28.89 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  28.72 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  27.37 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0897  methionyl-tRNA formyltransferase  27.6 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  27.18 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  28.37 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0415  methionyl-tRNA formyltransferase  23.61 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.467918  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0017  formyl transferase domain-containing protein  35.04 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  24.2 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  29.51 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  27.24 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  26.27 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3859  methionyl-tRNA formyltransferase  26.34 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  28.18 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  23.5 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1412  methionyl-tRNA formyltransferase  23.32 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2150  methionyl-tRNA formyltransferase  21.72 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  26.71 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  30.42 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  22.69 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0487  methionyl-tRNA formyltransferase  27.09 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3142  methionyl-tRNA formyltransferase  30.11 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  25.17 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  27.03 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  26.21 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  26.94 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  23.83 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2627  methionyl-tRNA formyltransferase  30.17 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.640895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  27.97 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  22.69 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>