More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5625 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5625  formyl transferase domain-containing protein  100 
 
 		 287 aa  579  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.165091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1190  formyl transferase domain protein  75.69 
 
 		 288 aa  454  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.738205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1060  formyl transferase domain-containing protein  75.69 
 
 		 288 aa  455  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0982  formyl transferase domain protein  79.86 
 
 		 288 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1761  formyl transferase domain protein  74.65 
 
 		 288 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5456  formyl transferase domain-containing protein  75 
 
 		 288 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0931925 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5891  formyl transferase domain-containing protein  49.82 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487641  normal  0.0186917 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5673  formyl transferase domain-containing protein  49.46 
 
 		 284 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384109 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  28.22 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00312  methionyl-tRNA formyltransferase  28.78 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  25.26 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1644  methionyl-tRNA formyltransferase  31.98 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  29.39 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1236  formyltransferase, putative  21.65 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000369668  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0284  methionyl-tRNA formyltransferase  29.46 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0176978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1943  formyl transferase domain protein  41.73 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1412  methionyl-tRNA formyltransferase  23.53 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0663  methionyl-tRNA formyltransferase  24.43 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2249  formyl transferase domain protein  30.46 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319035 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0383  methionyl-tRNA formyltransferase  23.87 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2150  methionyl-tRNA formyltransferase  20.48 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  23.2 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  23.2 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0319  formyl transferase domain-containing protein  34.78 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0907  methionyl-tRNA formyltransferase  25.21 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000822843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  28.99 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4569  formyl transferase domain-containing protein  27.63 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  26.2 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  24.24 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  24.24 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  26.96 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  25.46 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  24.32 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  24.39 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  25.61 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  23.02 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  22.26 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  21.23 
 
 		 319 aa  57  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2627  methionyl-tRNA formyltransferase  28 
 
 		 314 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.640895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0017  formyl transferase domain-containing protein  29.83 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0316  methionyl-tRNA formyltransferase  22.53 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  24.65 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1514  methionyl-tRNA formyltransferase  24.34 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2402  amino acid adenylation  38.71 
 
 		 1519 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2468  formyl transferase domain protein  35.45 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0908762 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  24.32 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  24.32 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  24.32 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2763  formyl transferase domain protein  54.72 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1025  formyl transferase domain protein  26.57 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0205  methionyl-tRNA formyltransferase  23.83 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  26.83 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1095  formyl transferase domain protein  27.06 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3523  methionyl-tRNA formyltransferase  20.95 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  23.73 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0897  methionyl-tRNA formyltransferase  23.83 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3690  formyl transferase domain protein  25.88 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  24.32 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2156  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  26.39 
 
 		 660 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3943  formyl transferase domain protein  27.05 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0655698 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.86 
 
 		 195 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4901  formyl transferase domain protein  31.03 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0747809  normal  0.14631 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30 
 
 		 195 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30 
 
 		 195 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30 
 
 		 195 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30 
 
 		 195 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0915  hypothetical protein  31.5 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30 
 
 		 195 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30 
 
 		 195 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0964  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.19 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597426 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  30.14 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2540  formyl transferase domain-containing protein  52.83 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.05523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  21.22 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000190251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.2 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  24.32 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  23.37 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  26.06 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  29.35 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  30.14 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4501  formyl transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 564 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  28.8 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0678  methionyl-tRNA formyltransferase  21.6 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.31 
 
 		 211 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2926  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  31.25 
 
 		 672 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0633  formyl transferase domain protein  23.08 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353643  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  22.53 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.17 
 
 		 195 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.17 
 
 		 195 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  21.35 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  28.8 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  28.8 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1729  methionyl-tRNA formyltransferase  25.87 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0924  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  26.26 
 
 		 660 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68062 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  28.8 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0276  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.13 
 
 		 195 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  28.8 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  21.35 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  24.65 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  28.8 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  24.49 
 
 		 326 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>