More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3284 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  100 
 
 
403 aa  809    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  72.59 
 
 
422 aa  560  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  70.18 
 
 
406 aa  542  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  53.5 
 
 
406 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  56.27 
 
 
479 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  53 
 
 
406 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  52.13 
 
 
415 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  53 
 
 
406 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  53.92 
 
 
403 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  52.87 
 
 
409 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  53.42 
 
 
403 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  54.45 
 
 
406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  51.5 
 
 
419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  52.91 
 
 
412 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  52.13 
 
 
420 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  51.51 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  51.51 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  50.75 
 
 
424 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  50.88 
 
 
451 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  51.38 
 
 
420 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 
440 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  49.87 
 
 
416 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 
406 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  49.87 
 
 
416 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
406 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  50.13 
 
 
416 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  48.64 
 
 
418 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  48.23 
 
 
405 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  50.76 
 
 
408 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  50.76 
 
 
408 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  46.87 
 
 
416 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 
411 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  50 
 
 
416 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  50.25 
 
 
408 aa  363  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  50 
 
 
416 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  50 
 
 
416 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  51.67 
 
 
360 aa  361  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  45 
 
 
421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  48.76 
 
 
415 aa  355  5.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  45.2 
 
 
415 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  47.9 
 
 
423 aa  346  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  52.76 
 
 
424 aa  346  5e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  47.86 
 
 
408 aa  345  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  48.36 
 
 
410 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  49.87 
 
 
404 aa  341  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  51.55 
 
 
421 aa  339  5.9999999999999996e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  45.86 
 
 
413 aa  338  8e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  49.5 
 
 
416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  49.1 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 
412 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  46.46 
 
 
411 aa  335  9e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  44.72 
 
 
413 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  45.5 
 
 
410 aa  328  9e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  44.72 
 
 
412 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  43.72 
 
 
433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  42.2 
 
 
428 aa  307  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  44.36 
 
 
429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  43.22 
 
 
427 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  40.8 
 
 
454 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  42.51 
 
 
457 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  40.2 
 
 
403 aa  291  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  41.29 
 
 
414 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  43.75 
 
 
399 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  44.36 
 
 
412 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  43.1 
 
 
455 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  39.18 
 
 
411 aa  272  6e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 
401 aa  272  9e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  39.47 
 
 
437 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  40.36 
 
 
407 aa  268  8.999999999999999e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  40.59 
 
 
427 aa  260  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  39.64 
 
 
414 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  43.8 
 
 
421 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  38.92 
 
 
427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  39.59 
 
 
401 aa  252  9.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  39.23 
 
 
418 aa  252  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 
427 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 
415 aa  249  6e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  37.53 
 
 
499 aa  249  7e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  38.56 
 
 
418 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 
425 aa  246  6.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  37.9 
 
 
410 aa  245  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  38.64 
 
 
424 aa  238  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  37.96 
 
 
427 aa  237  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 
416 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 
414 aa  209  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  33.68 
 
 
415 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  34.88 
 
 
524 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  32.19 
 
 
415 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  30.71 
 
 
418 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  30.89 
 
 
474 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 
445 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  28.35 
 
 
505 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 
412 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
438 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  32.32 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
447 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  29.86 
 
 
418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>