297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0490 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0490  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  576  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  49.83 
 
 
290 aa  279  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  34.01 
 
 
310 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  28.52 
 
 
302 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  28.33 
 
 
297 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  29.12 
 
 
299 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  26.55 
 
 
304 aa  95.9  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  26.12 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 
310 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1236  hypothetical protein  27.07 
 
 
307 aa  92.8  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  28.84 
 
 
321 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  28.57 
 
 
321 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 
326 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  24.72 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  24.83 
 
 
314 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 
313 aa  89.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  26.48 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  27.27 
 
 
379 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  27.03 
 
 
297 aa  87  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  24.31 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  25.19 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  24.82 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  26.78 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  26.42 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  21.8 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.04 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.88 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  25.87 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.88 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  23.78 
 
 
303 aa  79  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  26.76 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  24.75 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  24.83 
 
 
310 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  22.43 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.54 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.01 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  25 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  25.8 
 
 
289 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  25.54 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  24.57 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  27.15 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.1 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.5 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  26.92 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  24.42 
 
 
290 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  24.04 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.3 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  26.33 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  26.22 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  25 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  23.74 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  22.9 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  26.8 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  24.92 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  26.74 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  25 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  24.04 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  25.5 
 
 
308 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  25.5 
 
 
308 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  26.33 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  26.27 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.45 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  27.11 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.74 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  27.35 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  24.18 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  24.41 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  24.7 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  24.41 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  25.28 
 
 
301 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  27.64 
 
 
295 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.71 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.32 
 
 
308 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  22.55 
 
 
314 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  25.7 
 
 
308 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.71 
 
 
324 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  24.19 
 
 
294 aa  62.8  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  25.44 
 
 
311 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  26.32 
 
 
308 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  20.75 
 
 
295 aa  62.4  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  24.34 
 
 
298 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  25.26 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  23.96 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  24.23 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  24.06 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  25.26 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  23.96 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  24.91 
 
 
310 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  24.73 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  24.91 
 
 
310 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  24.91 
 
 
310 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  23.96 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 
290 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>