35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2596 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  78.52 
 
 		 854 aa  1382    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  100 
 
 		 887 aa  1808    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  100 
 
 		 887 aa  1808    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  27.02 
 
 		 869 aa  227  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  26.08 
 
 		 869 aa  187  9e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  27.37 
 
 		 833 aa  180  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  25.86 
 
 		 880 aa  177  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  25.2 
 
 		 872 aa  160  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  26.36 
 
 		 896 aa  158  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  25.57 
 
 		 873 aa  157  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  23.55 
 
 		 895 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  26.93 
 
 		 868 aa  140  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  25.45 
 
 		 881 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  24.42 
 
 		 891 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  23.99 
 
 		 897 aa  121  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  23.32 
 
 		 781 aa  119  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  32.81 
 
 		 878 aa  100  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  44.68 
 
 		 874 aa  78.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3325  hypothetical protein  23.36 
 
 		 763 aa  63.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  27.18 
 
 		 844 aa  61.2  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  22.22 
 
 		 643 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  62.5 
 
 		 597 aa  53.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  41.03 
 
 		 849 aa  51.2  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  38.96 
 
 		 890 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  34.55 
 
 		 700 aa  49.7  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  40.48 
 
 		 770 aa  49.3  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 481 aa  47.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  39.71 
 
 		 796 aa  46.6  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6712  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  30.72 
 
 		 241 aa  45.8  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.95 
 
 		 276 aa  45.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  33.02 
 
 		 248 aa  45.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  27.27 
 
 		 717 aa  44.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  40 
 
 		 877 aa  45.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0174  ABC transporter related  36.49 
 
 		 253 aa  44.3  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0313265  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  39.58 
 
 		 260 aa  44.3  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>