More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3619 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  100 
 
 		 361 aa  733    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  66.57 
 
 		 361 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  66.12 
 
 		 366 aa  471  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  65.19 
 
 		 361 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  66.39 
 
 		 366 aa  467  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  64.93 
 
 		 368 aa  461  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  65.19 
 
 		 362 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  64.92 
 
 		 361 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  66.57 
 
 		 366 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  64.04 
 
 		 364 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  65.18 
 
 		 367 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  63.23 
 
 		 362 aa  458  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  65.19 
 
 		 362 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  62.67 
 
 		 369 aa  454  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  63.2 
 
 		 371 aa  454  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  63.79 
 
 		 361 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  64.33 
 
 		 384 aa  454  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  63.2 
 
 		 361 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  63.54 
 
 		 371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  63.23 
 
 		 364 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  64.15 
 
 		 366 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  63.76 
 
 		 361 aa  451  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  61.84 
 
 		 364 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  62.67 
 
 		 365 aa  450  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  61.56 
 
 		 364 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  62.4 
 
 		 365 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  61.56 
 
 		 364 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  61.56 
 
 		 364 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  61.56 
 
 		 364 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  63.76 
 
 		 368 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  61.56 
 
 		 364 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  60.72 
 
 		 363 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2757  chorismate synthase  65.84 
 
 		 366 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  60.72 
 
 		 363 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2623  chorismate synthase  65.47 
 
 		 366 aa  441  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  60.11 
 
 		 366 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0730  chorismate synthase  62.71 
 
 		 364 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  59.89 
 
 		 373 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  64.89 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1833  chorismate synthase  65.73 
 
 		 365 aa  437  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  59.38 
 
 		 365 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  62.43 
 
 		 373 aa  435  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  62.6 
 
 		 370 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0627  chorismate synthase  62.71 
 
 		 365 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0254313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  62.46 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  58.5 
 
 		 366 aa  433  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3017  chorismate synthase  62.12 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503026  normal  0.557092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3176  chorismate synthase  66.67 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  63.31 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  61.9 
 
 		 366 aa  431  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1416  chorismate synthase  62.4 
 
 		 364 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.25436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1481  chorismate synthase  62.4 
 
 		 364 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1469  chorismate synthase  62.4 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0685488 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2416  chorismate synthase  62.4 
 
 		 364 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2995  chorismate synthase  60.22 
 
 		 365 aa  428  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0586  chorismate synthase  63.26 
 
 		 365 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2588  chorismate synthase  61.56 
 
 		 364 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3216  chorismate synthase  65.56 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  0.10403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0539  chorismate synthase  62.43 
 
 		 364 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  61.34 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  62.18 
 
 		 366 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1205  chorismate synthase  62.26 
 
 		 360 aa  430  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0521105  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  61.9 
 
 		 366 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  62.18 
 
 		 366 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  61.06 
 
 		 366 aa  428  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  61.9 
 
 		 366 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  64.15 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  64.15 
 
 		 361 aa  424  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0397  chorismate synthase  58.84 
 
 		 364 aa  426  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209987  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0428  chorismate synthase  61.88 
 
 		 364 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1453  chorismate synthase  63.41 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.71846  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0435  chorismate synthase  61.88 
 
 		 364 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  61.58 
 
 		 368 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2990  chorismate synthase  65.29 
 
 		 366 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1638  chorismate synthase  61.56 
 
 		 364 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  64.15 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0392  chorismate synthase  64.46 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  61.62 
 
 		 366 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  64.15 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  60.5 
 
 		 366 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  59.38 
 
 		 376 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1345  chorismate synthase  63.87 
 
 		 361 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1830  chorismate synthase  63.79 
 
 		 363 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  58.22 
 
 		 352 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  60.78 
 
 		 366 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3880  chorismate synthase  63.79 
 
 		 363 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00247284  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1408  chorismate synthase  63.51 
 
 		 363 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  62.95 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  58.22 
 
 		 352 aa  423  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  60.5 
 
 		 369 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  60.5 
 
 		 369 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  60.5 
 
 		 369 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  60.5 
 
 		 369 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3591  chorismate synthase  63.76 
 
 		 363 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  60.5 
 
 		 369 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1958  chorismate synthase  62.67 
 
 		 393 aa  418  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  60.22 
 
 		 369 aa  418  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1438  chorismate synthase  63.79 
 
 		 363 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0279248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42760  chorismate synthase  63.76 
 
 		 363 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2593  chorismate synthase  63.87 
 
 		 361 aa  418  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>