More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3349 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3349  glutamate 5-kinase  100 
 
 
377 aa  756    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0434084  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  53.31 
 
 
373 aa  364  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  51.08 
 
 
372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  51.92 
 
 
373 aa  351  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  49.32 
 
 
373 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
371 aa  346  4e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 
390 aa  346  4e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  48.48 
 
 
372 aa  342  8e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
378 aa  335  5.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
372 aa  335  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  51.1 
 
 
376 aa  334  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  50.69 
 
 
372 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  50.54 
 
 
373 aa  332  6e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
372 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  47.81 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
372 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
372 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
394 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
372 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
372 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
372 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
372 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  48.91 
 
 
372 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  49.73 
 
 
372 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  50.56 
 
 
373 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  49.32 
 
 
372 aa  319  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  48.11 
 
 
393 aa  319  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  50.56 
 
 
373 aa  318  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  48.91 
 
 
372 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 
374 aa  318  9e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  49.45 
 
 
373 aa  318  9e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  51.79 
 
 
378 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  49.32 
 
 
372 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  48.09 
 
 
372 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  48.24 
 
 
378 aa  316  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 
372 aa  316  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 
372 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 
372 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  47.3 
 
 
393 aa  316  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  47.78 
 
 
389 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  49.18 
 
 
373 aa  316  5e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  49.17 
 
 
370 aa  316  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 
372 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  46.98 
 
 
368 aa  315  6e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
375 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  47.86 
 
 
375 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  47.67 
 
 
367 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  44.35 
 
 
373 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  47.97 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  49.33 
 
 
374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  48.09 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  47.81 
 
 
372 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  47.81 
 
 
372 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  47.5 
 
 
389 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  46.41 
 
 
376 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  47.93 
 
 
367 aa  311  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  48.33 
 
 
374 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  47.66 
 
 
370 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  47.66 
 
 
374 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  49.04 
 
 
368 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  46.9 
 
 
374 aa  310  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  48.08 
 
 
374 aa  310  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  53.68 
 
 
377 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  47.93 
 
 
363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 
376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  47.25 
 
 
367 aa  308  6.999999999999999e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  47.78 
 
 
386 aa  308  8e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  47.92 
 
 
379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  46.83 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  48.64 
 
 
374 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  46.15 
 
 
374 aa  307  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  48.48 
 
 
378 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  49.45 
 
 
373 aa  306  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  48.22 
 
 
390 aa  306  3e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  43.43 
 
 
387 aa  305  6e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  47.65 
 
 
376 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  47.66 
 
 
369 aa  305  8.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  49.46 
 
 
374 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 
372 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  49.04 
 
 
383 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  44.35 
 
 
373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  47.65 
 
 
376 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  49.59 
 
 
372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  47.92 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  47.93 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  47.66 
 
 
378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  46.34 
 
 
375 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  48.37 
 
 
374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  49.18 
 
 
380 aa  302  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  50 
 
 
372 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  48.76 
 
 
372 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  46.88 
 
 
382 aa  301  9e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  45.9 
 
 
369 aa  301  9e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  48.12 
 
 
366 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  47.49 
 
 
375 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  46.83 
 
 
378 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>